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标签: ddRAD测序

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  • Dryad_Based_银行田鼠气候适应基因组特征研究数据

    2026年1月30日 30 205 114

    数据集概述 本数据集基于ddRAD测序技术，分析了欧洲12个种群276只银行田鼠的基因组数据（21,892个SNPs）与地理气候变异的关联，识别出213个适应候选位点（74个位于基因内），涉及脂质代谢和免疫系统相关基因，揭示气候对其适应性遗传变异的影响，包含9个相关文件。 文件详解 说明文件 文件名称：README.md 文件格式：MD...
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  • Fagus_ddRAD_Based欧洲山毛榉基因组测序数据

    2026年1月30日 30 5 2

    数据集概述 本数据集包含欧洲山毛榉（Fagus sylvatica sensu lato）的ddRAD测序数据，主要来源于Stacks分析得到的SNPs数据及配套信息，包含基因型数据、注释文件、覆盖度表格、种群数据等8个文件，用于植物基因组学相关研究。 文件详解 基因型数据文件 文件名称：genotypes.7z、genotypes_exons-...
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  • Amia_Based弓鳍鱼物种多样性分子与形态学研究数据集

    2026年1月30日 30 60 22

    数据集概述 本数据集包含弓鳍鱼（Amia）物种多样性研究的分子与形态学数据，通过ddRAD测序和形态学分析揭示其隐存物种多样性。数据支持将现存弓鳍鱼划分为两个物种，涉及系统发育分析文件、形态测量数据及标本信息，共8个文件。 文件详解 说明文件 文件名称：README.md 文件格式：MD 字段映射介绍：数据集说明文档，概述文件内容及研究背景。...
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  • Littorina_saxatilis_西班牙滨螺生态型基因组分化研究数据

    2026年1月21日 30 38 7

    数据集概述 本数据集聚焦西班牙滨螺（Littorina saxatilis）的平行生态物种形成研究，包含三个不同地点潮间带个体的ddRAD测序数据，涉及4256个SNP标记，分析了地理隔离对基因组分化平行性的影响，以及中间表型个体的杂交情况，揭示地理分离是基因组分化的主要来源。 文件详解 文件名称：Kess Galindo Boulding...
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  • Dryad_Based_马达加斯加棕榈巨型食果动物扩散基因组特征研究重现数据

    2026年1月20日 30 184 64

    数据集概述 本数据集包含重现马达加斯加棕榈巨型食果动物介导扩散基因组特征分析所需的代码与数据。研究评估了四种不同果实大小棕榈的种群历史、遗传分化及近期迁移情况，整合了ddRAD测序数据、动植物分布范围、景观及人类影响数据，探索遗传变异驱动因素。 文件详解 文件名称：README.md 文件格式：MD...
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  • Leucorrhinia_dubia_Palearctic地区遗传分化研究数据

    2026年1月20日 30 31 25

    数据集概述 本数据集呈现了北极圈蜻蜓Leucorrhinia dubia在古北界地区的空间遗传结构，基于ddRAD测序技术分析，涵盖欧洲9个地点、亚洲（俄罗斯和日本）3个地点的样本，以及日本的L. intermedia样本。结果显示欧洲存在三个不同遗传集群，亚洲样本形成独立集群，反映末次冰期后的历史...
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  • Picea_abies_Based_挪威云杉耐旱性基因多态性与生理性状关联研究数据

    2026年1月18日 30 27 6

    数据集概述 本数据集包含斯洛伐克中部5个海拔梯度（550至1280米）挪威云杉种源在干旱胁迫和对照（充分浇水）条件下的研究数据，涵盖生理性状、ddRAD测序数据及nSSR基因型三类内容，共6个文件，用于分析基因多态性与生理性状的关联。 文件详解 生理性状数据文件...
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  • Seascape_Genetics_Based_阿拉伯半岛双带海葵鱼基因结构分析数据

    2026年1月18日 30 52 25

    数据集概述 本数据集基于ddRAD测序技术，分析阿拉伯半岛红海及亚丁湾双带海葵鱼（Amphiprion bicinctus）及阿曼特有种（Amphiprion omanensis）的基因结构，探究地理与环境因素对基因流的影响，包含基因数据、分析脚本及结果文件共9份，支持海洋生物基因结构与杂交模式研究。 文件详解 信息类文件...
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  • Gila_Colorado_River_Basin_北美西部沙漠鱼类杂交基因侵蚀研究数据

    2026年1月13日 30 122 15

    数据集概述 本数据集围绕北美西部科罗拉多河流域两种特有同域鱼类（Gila cypha和G. robusta）的杂交基因侵蚀展开研究，包含368个个体的ddRAD测序相关数据，用于分析人为栖息地改变对物种繁殖隔离、基因渐渗及生物多样性的影响。 文件详解 样本元数据文件 文件名称：gila_ub_sra_metadata.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • Lesser_Sandeel_Genomic_Data_北海南海小沙丁鱼群体遗传结构研究数据集2019

    2026年1月3日 30 13 5

    数据集概述 本数据集为论文“Weak genetic structure despite strong genomic signal in lesser sandeel in the North...
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  • Oryctes_rhinoceros_Based_椰子犀牛甲虫生物型跨太平洋进化路径与防控策略研究数据

    2026年1月3日 30 37 23

    数据集概述 本数据集包含椰子犀牛甲虫（Oryctes rhinoceros）生物型的种群基因组分析相关文件，覆盖172个样本的ddRAD测序数据处理、遗传结构分析、系统发育树构建等内容，用于探究其跨太平洋进化路径及抗病毒生物型的入侵机制，为该害虫的防控策略优化提供基因组学依据。 文件详解 代码文件（.R、.py、.txt格式，共6个）...
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  • 白鲟_Acipenser_sturio_遗传监测单核苷酸多态性_SNP_与短串联重复序列_STR_比较数据

    2025年12月31日 30 158 54

    数据集概述 本数据集为极危物种欧洲鲟（Acipenser sturio）的遗传监测研究数据，包含通过ddRAD测序发现的79个SNP标记及其与传统STR标记的对比分析结果，涉及195尾已知谱系幼鱼和40尾野生成鱼的基因分型数据，用于评估两种标记在亲缘关系鉴定、近交系数估计等保护遗传学应用中的有效性。 文件详解 GENOYPES 40 SAMPLES...
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  • 温带竹类辐射与网状进化历史分析数据集

    2025年12月20日 30 10 4

    数据集概述 本数据集围绕温带竹类（Arundinarieae族）的进化历史展开，包含通过ddRAD测序和基因组浅层测序（genome skimming）获得的核基因与叶绿体基因组数据，以及系统发育分析结果，为研究古多倍体和快速辐射类群的进化关系提供支持。 文件详解...
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  • 埃塞俄比亚特有层状齿鼠基因组多样性研究数据集

    2025年12月19日 30 18 2

    数据集概述 本数据集为埃塞俄比亚特有层状齿鼠（Otomys属）基因组多样性研究的配套表格数据，记录了ddRAD测序生成的不同占有率数据集的核心指标，包括基因座数、单核苷酸多态性、简约信息位点及样本量，为物种进化历史与分类研究提供支撑。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射:...
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  • 亚马逊细身安乐蜥性信号变异的进化驱动因素数据集

    2025年12月9日 30 67 53

    数据集概述 本数据集围绕亚马逊细身安乐蜥（Anolis fuscoauratus）的性信号（喉扇颜色）变异展开，探究遗传分化、环境梯度及近缘物种共存对其变异的影响，为平行性状进化及信号性状在物种形成中的作用研究提供支持。 文件详解 数据文件（CSV格式）：...
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