数据集概述
本数据集包含391份全球野生拟南芥材料的种子油成分分析结果及全基因组关联研究(GWAS)数据,涉及9种主要脂肪酸及4种复合脂肪酸指标。通过GWAS识别出与种子油成分变异相关的基因区域,为十字花科植物脂肪酸比例的生物工程优化提供靶点,共含5个数据文件。
文件详解
- Excel表格文件(共3个)
- 文件名称:TableS1.xlsx、TableS2.xlsx、TableS3.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:GWAS关联分析的补充表格,包含拟南芥种子油成分相关的基因区域、候选基因及关联信号等核心研究结果
- CSV数据文件(共2个)
- 文件名称:bioBC_FAs.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:含ecoID(生态型ID)、Replicate(重复)及BC160、BC180等9种脂肪酸和4种复合脂肪酸的标准化数据字段
- 文件名称:bio_FAprops.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:含ecoID、Replicate及X16_0、X18_0等9种脂肪酸比例和sat(饱和脂肪酸)、PUFA(多不饱和脂肪酸)等4种复合指标的原始比例数据字段
数据来源
论文“Genome-wide association study of Arabidopsis thaliana identifies determinants of natural variation in seed oil composition”
适用场景
- 植物脂肪酸代谢基因功能研究: 利用GWAS关联区域识别调控种子油成分的关键基因,解析脂肪酸合成与分解机制
- 十字花科作物分子育种: 以拟南芥候选基因为靶点,优化油菜等十字花科作物的种子油脂肪酸比例
- 植物脂质组学分析: 通过脂肪酸组成数据研究拟南芥种子油代谢通路的自然变异规律
- 生物柴油原料优化研究: 筛选调控高价值脂肪酸比例的基因,为生物柴油专用作物的生物工程提供数据支持