找到81个数据集

标签: GWAS

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  • 全基因组分析犬类IgA缺乏症机制数据

    2026年2月15日 30 9 2

    数据集概述 本数据集是犬类IgA缺乏症(IgAD)全基因组关联研究(GWAS)的相关数据,针对德国牧羊犬、金毛寻回犬等四个易患低IgA水平的犬种,通过新型百分位组方法确定品种特异性阈值,识别出35个与IgA水平相关的基因组位点,包括KIRREL3、SERPINA9、SLIT1等候选基因,涉及B细胞发育等免疫机制。数据集包含1个压缩文件。 文件详解...
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  • GWAS_Based_表型数据集

    2026年2月12日 30 70 9

    数据集概述 本数据集为GWAS(全基因组关联研究)表型数据,包含一份完整数据集文件,未涉及训练/测试、数据/标签或原始/处理数据的拆分,文件类型单一,主要用于GWAS相关的表型分析场景。 文件详解 文件名称:heirloom biochem full dataset including spring 2015.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 基于LD集群的全基因组关联映射方法数据集

    2026年2月9日 30 68 22

    数据集概述 本数据集包含基于连锁不平衡(LD)聚类的全基因组关联研究(GWAS)方法相关文件,涉及基因组窗口划分、LD网络分析与主成分分析的降维工具,以及适用于野生样本或双亲子代F2群体的单/多基因座关联测试模型,可用于生态遗传学定位研究,附植物(拟南芥)、鱼类(三刺鱼)公开数据集及模拟数据的方法验证文件。 文件详解 README文件:...
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  • GxE_Based基因环境互作研究数据集

    2026年2月9日 30 137 19

    数据集概述 本数据集为GxE(基因-环境互作)研究论文配套数据,包含RIL群体的基因型数据、表型数据及天气数据,共14个文件,以CSV格式为主,涵盖标记信息、性状指标、气象参数等内容,用于支持基因与环境互作相关分析。 文件详解 基因型数据文件...
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  • 北欧春小麦SNB抗性全基因组关联分析数据集

    2026年2月9日 30 140 105

    数据集概述 本数据集为北欧春小麦群体对小麦 septoria nodorum 叶枯病(SNB)抗性的全基因组关联分析(GWAS)数据。包含七年田间成株期抗病性鉴定、温室苗期接种及毒素敏感性测定的表型数据,以及对应基因型数据,用于定位SNB抗性相关数量性状位点(QTL)。 文件详解 文件名称:Ruud et al GWAS - Genotype...
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  • GWAS_Based_猪血脂性状遗传异质性研究数据

    2026年2月9日 30 192 101

    数据集概述 本数据集基于猪血脂性状全基因组关联分析(GWAS),包含莱芜猪、二花脸猪、杜洛克×(长白×约克夏)等猪群的血脂相关遗传数据,涉及六个血脂性状的22个基因组位点,以及5个新发现的关联位点,揭示了猪血脂水平的遗传异质性特征,为猪血脂性状的遗传机制研究提供支持。 文件详解 文件名称:Primary_data.zip 文件格式:ZIP...
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  • DArTseq_Based西班牙羽扇豆种质资源标记数据

    2026年2月9日 30 62 7

    数据集概述 本数据集包含西班牙羽扇豆(Lupinus hispanicus)种质资源的DArT-seq标记(SNP/PAV),用于全基因组关联研究(GWAS)。数据支撑2025年Bielski W.等人发表的关于西班牙羽扇豆物候遗传结构的分子解析研究,涉及早花及冬播/春播适应性分析,数据集含1个文件。 文件详解 文件名称:DArTseq markers...
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  • GWAS结核菌素皮肤试验反应性基因关联数据

    2026年2月1日 30 11 6

    数据集概述 本数据集为东非结核病高流行区HIV阳性个体结核菌素皮肤试验(TST)反应性的全基因组关联研究(GWAS)数据,包含坦桑尼亚和乌干达队列的基因分型数据、统计模型结果及文件说明文档,用于分析与MTB感染抵抗相关的遗传位点,特别是5q31.1区域与IL9基因的关联。 文件详解 基因分型数据文件 文件名称:tanzanian map...
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  • 大麦HsDry2_2基因座产量性状关联分析数据

    2026年2月1日 30 136 101

    数据集概述 本数据集包含大麦HEB-25多亲本作图群体在两年、两种水分环境(充分灌溉WW和水分限制WL)下的基因型和田间表型数据,涉及开花时间(HEA)、单株产量(PGY)等10个性状,用于全基因组关联分析(GWAS)挖掘与环境互作的数量性状位点(QTL),重点研究2号染色体HsDry2.2基因座对产量性状的调控作用。 文件详解 文件名称:LOM et...
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  • ETV6_Based结直肠癌易感性基因变异研究数据

    2026年1月31日 30 101 19

    数据集概述 本数据集为结直肠癌易感性相关的GWAS研究数据,包含中国及欧洲人群的病例对照样本分析结果,聚焦12p13.2区域ETV6基因rs2238126变异与结直肠癌风险的关联,涉及发病年龄、转录增强子结合亲和力及肿瘤组织ETV6表达水平等研究内容。 文件详解 文件名称:Colorectal_cancer_data.zip 文件格式:ZIP...
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  • GS_Based_水稻基因组选择与关联映射研究数据

    2026年1月31日 30 183 85

    数据集概述 本数据集来自国际水稻研究所(IRRI)的水稻基因组选择与关联映射研究,针对363个精英育种系,通过73147个标记进行基因分型,结合全基因组关联研究(GWAS)和五倍交叉验证,分析基因组选择(GS)在水稻育种中的有效性,探索性状遗传结构、训练群体组成等因素对预测准确性的影响。 文件详解...
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  • GS_de_novo_GWAS_热带水稻基因组预测模型数据

    2026年1月30日 30 120 20

    数据集概述 本数据集包含热带水稻多环境试验表型数据及说明文档,用于支持结合de novo GWAS的基因组选择(GS)模型研究。该模型旨在提升水稻育种效率,应对气候变化等粮食安全挑战。数据集含2个文件,涵盖表型数据及文件说明。 文件详解 README_for_MET_2011_2012_pheno_data_all.rtf 文件格式:RTF...
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  • pLARmEB_Based_多基因座全基因组关联研究方法数据

    2026年1月29日 30 147 141

    数据集概述 本数据集支持pLARmEB方法(基于多基因背景控制的最小角回归结合经验贝叶斯)的应用,该方法用于多基因座全基因组关联研究(GWAS),可识别与复杂性状相关的数量性状核苷酸(QTNs),通过模型变换白化多基因矩阵协方差与环境噪声,平衡QTN检测能力、效应估计准确性与计算效率。 文件详解 文件名称:data.zip 文件格式:ZIP...
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  • 整合基因组学_哺乳动物肺泡巨噬细胞对细胞内分枝杆菌的反应数据集

    2026年1月29日 30 32 28

    数据集概述 本数据集基于牛肺泡巨噬细胞感染牛分枝杆菌(M. bovis)的转录组研究,包含24小时和48小时感染组与对照组的RNA-seq统计结果。通过差异表达、相关网络及差异表达网络三种方法生成6个基因集,并结合牛结核(bTB)品种GWAS数据,使用gwinteR工具整合分析,识别与感染易感性/抗性相关的优先级SNP,揭示不同牛品种的遗传差异。...
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  • Setaria_pan_genome_谷子泛基因组研究表型数据

    2026年1月28日 30 97 35

    数据集概述 本数据集包含用于谷子全基因组关联分析(GWAS)和基因组选择(GS)研究的226个表型数据,可用于基因鉴定、标记辅助育种、基因组选择及基因组编辑,以加速不同气候条件下的作物改良。数据集仅含一个文件。 文件详解 表型数据文件 文件名称:Phenotypes_226.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 利用全基因组关联分析_GWAS_增强玉米群体基因组预测的补充数据

    2026年1月28日 30 61 30

    数据集概述 本数据集为玉米多亲本群体中整合全基因组关联研究(GWAS)与基因组预测(GP)方法的研究补充数据,包含玉米嵌套关联作图群体的表型数据与标记数据,用于验证GWAS结果整合对GP准确性的提升效果,支持基因发现与基因组预测模型优化研究。 文件详解 README文件...
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  • Teno_Based_大西洋鲑鱼自然种群海龄变异遗传机制研究数据

    2026年1月28日 30 33 13

    数据集概述 本数据集包含北欧大西洋鲑鱼自然种群海龄变异的基因组SNP分析数据,通过GWAS和FST离群分析识别与海龄相关的基因组区域,涉及肌肉发育、代谢、免疫反应和配偶选择等相关基因,揭示海龄变异的遗传基础及种群分化机制。 文件详解 README文件 文件名称:README_for_TenoSeaAgeDryadData.txt 文件格式:TXT...
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  • HDHB_SNPAssay_蜜蜂100K单核苷酸多态性阵列开发数据

    2026年1月27日 0 73 13

    数据集概述 本数据集围绕新开发的蜜蜂高密度SNP基因分型阵列(含103270个SNP)展开,该阵列用于蜜蜂基因组选择、育种及进化适应研究。SNP通过对欧洲61只雄蜂全基因组重测序检测,筛选基于候选区域、基因及育种目标(产蜜量、温顺性、瓦螨抗性)等标准,包含阵列验证及使用建议相关数据,共4个文件。 文件详解...
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  • UK_Biobank_Based_背痛相关表型基因关联分析结果数据

    2026年1月27日 30 152 81

    数据集概述 本数据集为背痛相关表型的基因关联分析结果,基于英国生物银行(UK Biobank)的500K全基因组关联研究(GWAS)插补基因型数据和200K外显子测序(WES)数据生成,包含慢性背痛(CBP)、椎间盘疾病(IDD)、背痛(Dorsalgia)及综合表型(SGIT)四类表型的关联分析结果,共8个文件。 文件详解...
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  • WtCoxG_Based_加权Cox回归GWAS时间事件表型研究数据

    2026年1月26日 30 116 85

    数据集概述 本数据集为基于加权Cox回归(WtCoxG)方法的全基因组关联研究(GWAS)数据,针对时间事件表型设计。包含7个文件,涉及模拟研究与英国生物银行(UK Biobank)真实数据分析结果,覆盖2型糖尿病、冠状动脉粥样硬化等表型,用于验证WtCoxG方法的统计功效与准确性。 文件详解 CSV格式文件(共4个)...
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