数据集概述
本数据集为拟南芥种子油熔点自然变异的全基因组关联研究(GWAS)数据,包含391份自然种质的种子油成分分析结果及GWAS关联分析数据,验证了种子油熔点与采集地春秋季温度的适应性关联,定位到FAD2等关键基因位点。数据集共9个文件,支持植物适应性性状的遗传机制研究。
文件详解
- 核心数据文件(CSV格式,7个)
- 文件名称:TableS1.csv、TableS2.csv、TableS3.csv、TableS4.csv、TableS5.csv、TableS6.csv、TableS7.csv、TableS8.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含拟南芥自然种质的种子油成分数据、采集地温度数据、GWAS关联分析的SNP位点及P值等核心研究数据
- 补充表格文件(XLSX格式,1个)
- 文件名称:TableS1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:作为补充表格,可能包含种子油成分或研究样本的详细描述信息
- 基因注释文件(TXT格式,1个)
- 文件名称:TableS9.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含基因座标识符、基因模型名称、基因功能描述、基因符号等注释信息,如AT3G12900对应的2-氧戊二酸依赖性加氧酶超家族蛋白注释
数据来源
论文“Genome-wide association study in Arabidopsis thaliana of natural variation in seed oil melting point, a widespread adaptive trait in plants”
适用场景
- 植物适应性性状遗传机制研究: 分析种子油熔点与环境温度的关联及遗传基础
- 植物油脂代谢基因功能验证: 验证FAD2、FATB等基因对种子油熔点的调控作用
- 作物分子育种应用: 为油料作物种子油品质的分子改良提供基因靶点参考
- 植物生态适应性分析: 探究植物性状与环境因子的协同进化关系