数据集概述
本数据集记录了通过高通量测序技术为叶口蝠科的广泛分布物种Artibeus lituratus开发微卫星位点的过程,包含发现的微卫星位点、设计的引物及跨物种扩增测试结果,为该物种及6种近缘叶口蝠科物种的种群遗传学研究提供标记资源。
文件详解
- README文件(共3个)
- 文件名称:README_for_S1_Alituratus_SeqQuality.txt、README_for_S1_Alituratus_Seq.txt、README_for_S2_Alituratus_AllPrimers.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:分别说明序列质量数据、序列数据库及引物数据的相关信息,包括数据来源、处理背景和关联信息。
- 序列文件
- 文件名称:S1_Alituratus_Seq.fna
- 文件格式:FNA
- 字段映射介绍:包含Artibeus lituratus基因组DNA的454测序原始序列数据库,每条序列带有唯一标识符、长度及运行信息。
- 引物文件
- 文件名称:S2_Alituratus_AllPrimers.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录为Artibeus lituratus设计的微卫星位点引物信息,包含适合侧翼区域的19395个位点的引物设计数据。
- 序列质量文件
- 文件名称:S1_Alituratus_SeqQuality.qual
- 文件格式:QUAL
- 字段映射介绍:包含454测序的序列质量数据,对应序列文件中的每条序列的质量信息。
数据来源
标题为“Rapid development and screening of microsatellite loci for Artibeus lituratus and their utility for six related species within Phyllostomidae”的研究
适用场景
- 种群遗传学研究:利用开发的微卫星标记分析Artibeus lituratus及相关物种的种群结构、遗传多样性。
- 微卫星标记开发方法验证:验证高通量测序技术在微卫星位点开发中的高效性与经济性。
- 跨物种标记适用性研究:分析微卫星标记在叶口蝠科近缘物种间的扩增成功率,支持多物种比较研究。
- 进化生物学研究:通过微卫星标记探究物种间的进化关系及短时间尺度的进化现象。