数据集概述
本数据集为AVETUXIRI临床试验相关数据,聚焦难治性微卫星稳定(MSS)转移性结直肠癌患者接受阿维鲁单抗、西妥昔单抗和伊立替康治疗的肿瘤免疫微环境影响,包含临床数据、基因表达数据及变异数据等,用于分析免疫相关生物标志物与治疗疗效的关联。
文件详解
该数据集包含数据集文件和脚本文件,具体说明如下:
- 数据集文件(位于AVETUXIRI/datasets/目录下):
- avetuxiri.xlsx、fp.xlsx、R_clincal_data.xlsx:Excel格式文件,可能包含临床试验的临床数据
- gene_count_matrix_full.csv:CSV格式文件,包含基因表达计数矩阵,字段示例为gene_id及各样本标识(如A10W0)
- transcript_count_matrix_full.csv:CSV格式文件,包含转录本表达计数矩阵,字段示例为transcript_id及各样本标识
- Avetuxiri_vcfs_mafs/目录:包含变异数据文件,如STRELKA2和MUTECT2生成的MAF文件、过滤后的VCF文件(如a01-010W11_T_D.filtered.vcf)及压缩包(如Indels_Strelka2.zip、SNVs_FiNGS_filtered.zip)
- 脚本文件(位于AVETUXIRI/scripts/目录下):
- 系列Rmd格式文件(如F2.Rmd、F4.Rmd、S4.Rmd等),可能为数据分析相关的R语言脚本
适用场景
- 肿瘤免疫学研究:分析MSS转移性结直肠癌肿瘤免疫微环境特征
- 临床疗效关联分析:探究免疫评分、细胞毒性T细胞与肿瘤细胞 proximity等生物标志物与治疗生存获益的关系
- 药物联合治疗研究:研究阿维鲁单抗、西妥昔单抗和伊立替康联合治疗的潜在作用机制
- 生物标志物开发:挖掘预测难治性MSS转移性结直肠癌治疗疗效的免疫相关生物标志物