找到86个数据集

标签: VCF

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  • Raeymaekers_NatCommun_2017_三刺与九刺棘鱼适应性分化研究数据

    2026年1月14日 30 66 14

    数据集概述 本数据集包含三刺和九刺棘鱼的基因分型及相关研究数据，用于分析两种亲缘关系相近的鱼类在共同生境中沿盐度梯度的中性与适应性分化差异。数据支撑对物种特异性适应能力、表型平行性与基因组非平行适应性的研究，共含3个文件。 文件详解 九刺棘鱼基因分型文件 文件名称：Raeymaekers et al-...
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  • Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据

    2026年1月13日 30 130 23

    数据集概述 本数据集为白足鼠（Peromyscus leucopus）的转录组资源，包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果，用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应，共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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  • Zosterops_borbonicus_based留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性进化数据

    2026年1月13日 30 118 17

    数据集概述 本数据集为留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性研究的支撑数据，包含该鸣禽高地种群中棕色与灰色羽毛表型的表型记录、基因组变异及微卫星等分子数据，用于揭示染色体1上新基因座对黑色素表型多态性的调控机制及平衡选择下的进化过程。 文件详解 文件名称：Localities_Morphs_individuals_VCF.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • Genome_wide_Rainbow_Darter_基因组多样性与热应激耐受性研究数据

    2026年1月13日 30 48 13

    数据集概述 本数据集围绕彩虹镖鲈（Etheostoma caeruleum）的基因组多样性与栖息地适应性展开，包含8个采样点（含独特湖泊栖息地）的形态特征、热耐受性及基因组数据，用于分析种群结构、遗传多样性与环境胁迫响应的关系，共9个文件。 文件详解 基因组与种群结构相关文件 文件名称：VCF_RDarters.vcf 文件格式：VCF...
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  • Corallorhiza_Lineage_Role_异养兰花复合群谱系与整合分类研究数据

    2026年1月13日 30 190 27

    数据集概述 本数据集为异养兰花Corallorhiza striata复合群的谱系与整合分类研究数据，包含基因组、形态、物候、繁殖模式、生态位及真菌宿主等多源数据，采用“谱系+生态角色”方法分析物种界定，涉及13个文件，覆盖序列比对、SNP数据、形态统计、开花时间等内容。 文件详解 基因组相关文件...
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  • Icelandic_isopods_Based_冰岛深海等足类物种形成与杂交整合研究数据

    2026年1月13日 30 202 109

    数据集概述 本数据集围绕冰岛深海等足类Haploniscus bicuspis的物种形成与杂交展开，整合线粒体COI序列、核基因座（ddRAD）、蛋白质组学图谱及形态特征数据，识别出5个遗传谱系，揭示了格陵兰-冰岛-法罗脊南北侧的物种分化、杂交及基因流情况，为深海生物进化研究提供多组学支撑，共包含34个文件。 文件详解 元数据与说明文件...
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  • Concordant_patterns_Coregonus物种形态同位素遗传变异研究数据

    2026年1月13日 30 144 104

    数据集概述 本数据集为研究苏必利尔湖西部Coregonus artedi复合体生态辐射的多维度数据，包含形态测量、稳定同位素及转录组SNP数据，共5个文件。数据用于分析物种间形态、生态与基因组变异的一致性，探究低遗传分化下的生态差异及物种形成机制，为理解生物多样性起源提供支持。 文件详解 README.docx 文件格式：DOCX...
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  • Necturus_maculosus_Based_水生蝾螈种群结构与基因流基因组评估数据

    2026年1月13日 30 157 152

    数据集概述 本数据集为水生蝾螈（Necturus maculosus）种群结构与基因流的基因组评估数据，包含美国肯塔基州三个流域（肯塔基河、利金河、金尼科尼克河）的基因组分析相关文件，用于探究河流网络结构、地理屏障等因素对种群遗传分化的影响。 文件详解 文件名称：bpp.zip 文件格式：ZIP...
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  • Galaxy_Training_Network_JBrowse基因组数据可视化教程数据集

    2026年1月13日 30 61 11

    数据集概述 本数据集是Galaxy Training Network中JBrowse基因组数据可视化教程的配套数据，包含10个不同类型的基因组相关文件，覆盖DNA测序、RNA-Seq、基因注释、变异数据等内容，用于支持JBrowse工具的可视化操作训练与实践。 文件详解 基因组序列文件 文件名称：genome.fa 文件格式：FA...
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  • TEP_Prionurus_Species_Based_热带东太平洋刺尾鱼物种界定研究数据

    2026年1月12日 0 1 0

    数据集概述 本数据集为热带东太平洋（TEP）Prionurus属刺尾鱼的物种界定研究数据，整合了线粒体基因、核基因位点、形态测量、生态位比较等多维度信息，用于分析带斑点与无斑点表型刺尾鱼的进化关系与物种界限，结果支持二者为同一物种。 文件详解 文件名称：Nobia-maf02_SNPS.vcf，格式：VCF...
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  • Dryad_Based_西南印度洋_Pocillopora_珊瑚种群基因组与连通性研究数据

    2026年1月12日 0 35 2

    数据集概述 本数据集包含西南印度洋4种Pocillopora珊瑚的种群基因组数据，通过目标捕获技术获取单核苷酸多态性（SNPs），覆盖9个采样点的千余个珊瑚群体。数据用于分析种群遗传结构、连通性及 demographic 历史，为珊瑚礁保护提供遗传学依据，共含16个文件。 文件详解 核心数据文件...
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  • Capsella_bursa_pastoris_Based_欧亚多倍体植物基因组殖民化研究数据

    2026年1月12日 30 60 7

    数据集概述 本数据集聚焦荠菜（Capsella bursa-pastoris）这一异源多倍体植物，通过基因分型测序获取261份欧亚大陆样本的4274个SNP位点，分析其基因组多样性、种群结构及殖民化历史，揭示其从中东向欧洲、东亚扩张的多阶段过程，为多倍体植物进化研究提供数据支持。 文件详解 README文件...
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  • Walleye_Harvest_Associated_野生白斑狗鱼种群体型与基因组变化研究数据

    2026年1月11日 0 165 30

    数据集概述 本数据集记录了魁北克Mistassini湖三个捕捞种群及一个低捕捞参考种群15年间的体型、年龄及基因组变化，包含约9000个SNP位点的分析数据，结合原住民知识，揭示捕捞诱导的表型与遗传耦合变化，为渔业资源管理提供依据。 文件详解 VCF文件（2个） 文件名称：Bowles_et_al-...
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  • Woods_2016_Brachypodium_distachyon开花时间变异遗传结构补充数据

    2026年1月11日 30 96 16

    数据集概述 本数据集是论文《Brachypodium distachyon开花时间变异的遗传结构》的补充数据，包含RIL群体（F7；Bd21×Bd1-1）的基因型、表型数据、遗传图谱、基因位置文件、QTL分析R脚本及目标基因的VCF文件，支持开花时间遗传机制研究。 文件详解...
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  • Bioclimatic_Model_Based_马达加斯加热带森林碳储量气候变化预测数据_研究数据集

    2026年1月3日 30 205 83

    数据集概述 本数据集基于生物气候包络模型，结合马达加斯加1771个森林样地（1996-2013年）数据，分析气候变量对热带森林地上碳密度的影响，预测2080年RCP8.5情景下碳储量变化。包含模型、栅格数据、投影文件等10个文件，支持森林碳储量与气候变化关系研究。 文件详解 文档文件 文件名称：README_for_ACD.txt 文件格式：TXT...
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  • Genome_wide_SNP_Based_Castanea_alabamensis非杂交起源研究数据

    2026年1月3日 30 100 74

    数据集概述 本数据集为支持Castanea alabamensis非杂交起源的全基因组序列分型研究数据，包含北美栗属（Castanea）多个类群（含美洲栗、矮栗及亚洲栗属物种）的基因组数据，通过十万余个单核苷酸多态性（SNP）位点分析，验证了Castanea alabamensis的非杂交起源，共包含4个文件。 文件详解 文档文件...
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  • Schistosoma_japonicum_Based_日本血吸虫尾蚴全基因组扩增与简化基因组测序实验数据

    2025年12月30日 30 127 59

    数据集概述 本数据集包含日本血吸虫尾蚴的全基因组扩增及简化基因组测序相关数据，涵盖实验方法验证、基因变异检测及初步群体结构分析结果，可支持血吸虫病监测中的感染源追溯、耐药性监测等研究，共含13个文件。 文件详解 数据文件 文件名称：S4Table.xlsx 文件格式：XLSX...
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  • Neutral_adaptive_Based_Coenagrion_scitulum极向扩张基因组特征研究数据

    2025年12月28日 30 46 36

    数据集概述 本数据集围绕豆娘Coenagrion scitulum快速极向扩张过程中的中性与适应性基因组特征展开，包含基因组SNP、表型、气候数据及单基因座和多基因座异常检测结果，旨在解析物种扩张中的遗传漂变与适应性进化机制，支持基因组学与进化生物学研究。 文件详解 基因组数据文件...
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  • Pocillopora_Based_Indo_Pacific珊瑚多标准物种界定研究数据_2023

    2026年1月9日 0 155 12

    数据集概述 本数据集为Indo-Pacific海域Pocillopora珊瑚的物种界定研究数据，基于基因组学、形态学、生物地理学及共生生态学多标准展开。包含356个珊瑚群体的全基因组SNP数据、微形态测量数据、共生藻关联数据等，用于解析该属珊瑚系统发育、提出物种假说并验证多证据一致性，支持珊瑚分类修订与保护。 文件详解 基因组与遗传数据...
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  • Poso_Oryzias_Based_Wallacean古湖稻田鱼资源分配与选型交配研究数据2021

    2026年1月4日 30 60 52

    数据集概述 本数据集为Wallacean古湖Lake Poso中同域分化稻田鱼（Oryzias属）的研究数据，包含基因组SNP、形态坐标、稳定同位素、卵大小及交配实验等6个文件，用于分析资源分配与选型交配的耦合关系，探讨无“魔法性状”下的同域物种形成机制。 文件详解 文件名称：README.txt 文件格式：TXT...
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