斑马鱼实验室驯化遗传特征数据集

数据集概述

该数据集通过RAD-seq技术对印度、尼泊尔、孟加拉国的野生斑马鱼种群及四种常见实验室品系进行遗传特征分析,对比野生种群与实验室品系的遗传多样性、杂合度等指标,揭示实验室驯化对斑马鱼遗传背景的影响。

文件详解

  • wildlabdanio.vcf.gz:VCF压缩格式文件,包含野生斑马鱼种群及实验室品系的遗传变异数据
  • wildlabdanio.vep_summary.html:HTML格式文件,可能是Variant Effect Predictor(VEP)的分析结果总结
  • wildlabdanio.sumstats.tsv:TSV格式文件,包含遗传多样性、杂合度等统计数据,预览显示包含AB_520至AB_547等样本标识
  • wildlabdanio.vep.tsv:TSV格式文件,由ENSEMBL VEP工具生成,包含变异位点的功能注释信息,预览显示版本为v96.3

适用场景

  • 斑马鱼遗传多样性研究:分析野生种群与实验室品系的遗传差异
  • 动物模型遗传背景评估:为实验室斑马鱼模型的遗传代表性提供数据支持
  • 分子生态学研究:探究尼泊尔、孟加拉国斑马鱼种群的独特遗传特征
  • 进化生物学研究:研究实验室驯化过程对斑马鱼遗传结构的影响
  • 药物研发应用:为斑马鱼药物测试模型的遗传背景选择提供参考
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 927.15 MiB
最后更新 2025年12月12日
创建于 2025年12月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。