数据集概述
本数据集是野生大麦(Hordeum spontaneum)在干旱胁迫下生殖成功差异相关基因的RNA-Seq分析数据,包含表型数据、说明文档及分析命令脚本。数据来自Barley1K收集的35份野生大麦材料,于2010年在以色列Atlit的Aaronson农场温室种植,旨在探究植物适应不同环境的进化基础,尤其是生殖阶段对干旱的响应机制。
文件详解
- 文件名称:README_for_PhenotypicData.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含表型数据的背景说明,如供试材料来源(Barley1K收集的野生大麦)、种植环境(以色列Atlit的Aaronson农场温室)、种植时间(2010年冬季)、材料处理方法(4% NaOH灭菌、4℃暗室萌发一周等)
- 文件名称:PhenotypicData.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:野生大麦干旱胁迫下生殖相关的表型数据,具体字段未明确说明
- 文件名称:commands.sh
- 文件格式:SH
- 字段映射介绍:RNA-Seq分析所用的命令脚本,用于参考基因组组装、差异表达分析等生物信息学流程
数据来源
标题为“Data from: RNA-Seq analysis identifies genes associated with differential reproductive success under drought-stress in accessions of wild barley Hordeum spontaneum”的研究
适用场景
- 植物干旱适应性进化研究: 分析野生大麦在干旱胁迫下生殖成功差异的分子机制,探究植物适应环境的进化基础
- 作物抗逆基因挖掘: 从野生大麦中筛选与干旱胁迫下生殖相关的候选基因,为栽培大麦的抗旱育种提供基因资源
- 农业基因组学分析: 利用RNA-Seq数据开展差异表达分析,研究干旱对植物生殖阶段基因表达的影响
- 植物表型组学研究: 结合表型数据与基因表达数据,解析野生大麦干旱胁迫下生殖性状的遗传基础