找到18个数据集

标签: RNASeq

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  • Guerrero_etal_茄属渐渗系基因表达调控分化研究数据

    2026年2月8日 30 95 48

    数据集概述 本数据集围绕茄属植物(多毛番茄与栽培番茄)种间渐渗系的全基因组转录调控分化机制展开,包含基因表达数据及处理脚本。通过分析四种组织(茎尖、成熟果实、花粉、种子)的表达模式,探究顺式与反式调控变化的贡献,以及渐渗区域与背景基因的表达差异,为植物表型进化的遗传基础研究提供数据支持。 文件详解...
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  • RNA_Seq_Based_海鞘物种杂交基因渗入分析数据

    2026年1月30日 30 49 33

    数据集概述 海洋入侵种海鞘的基因表达研究数据,通过RNA-Seq技术分析基因表达模式,为研究海洋无脊椎动物外来种的适应性进化提供分子层面的支持。 文件详解 基因表达数据文件 文件名称:Datafile_CrobCint_310SNPs.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • EPD_Based_人类髓系白血病细胞周期蛋白质组与转录组动态数据

    2026年1月27日 30 187 16

    数据集概述 本数据集记录了人类髓系白血病细胞在最小干扰条件下的细胞周期进程中,蛋白质与mRNA表达水平的动态变化。研究通过离心淘洗结合质谱蛋白质组学和RNA-Seq技术,避免人工同步处理,识别了髓系特异性基因表达、不同细胞周期阶段的蛋白质丰度变化、异构体表达及磷酸化修饰,解析了约六千个基因的蛋白与mRNA水平关系。 文件详解 压缩文件...
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  • easyMF_Based_基于矩阵分解的生物发现转录组数据分析平台数据

    2026年1月26日 30 124 73

    数据集概述 本数据集为easyMF平台相关数据,easyMF是一个用户友好的网络平台,通过矩阵分解技术从大规模转录组数据中促进生物发现,支持从原始测序读到基因表达的分析流程,可将基因表达矩阵分解为元基因,并提供基于元基因的探索性分析模块,数据包含九个Excel文件。 文件详解 文件名称:Table S1.xlsx、Table S2.xlsx、Table...
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  • Chickpea_RNASeq_鹰嘴豆基因测序原始数据与样本注释_数据集

    2026年1月22日 30 67 11

    数据集概述 本数据集为鹰嘴豆RNA测序(RNASeq)相关数据,包含样本注释文件和原始计数压缩包,总计2个文件。数据未进行训练/测试、数据/标签或原始/处理的拆分,可用于鹰嘴豆基因表达相关的基础分析与研究。 文件详解 样本注释文件 文件名称:samples_annotation.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • paleoMIXTA_based_植物MIXTA基因家族进化功能研究数据集

    2026年1月21日 30 106 33

    数据集概述 本数据集围绕真双子叶植物MIXTA基因家族祖先(paleoMIXTA)的进化历史与功能展开,包含23种唐松草属植物paleoMIXTA直系同源基因的克隆与系统发育分析、表达模式检测、功能验证及转录组分析结果,支持研究其在锥状细胞和毛状体发育中的联合作用。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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  • Barley1K_野生大麦干旱胁迫生殖成功差异基因RNA_Seq分析数据2010

    2026年1月19日 30 177 32

    数据集概述 本数据集是野生大麦(Hordeum spontaneum)在干旱胁迫下生殖成功差异相关基因的RNA-Seq分析数据,包含表型数据、说明文档及分析命令脚本。数据来自Barley1K收集的35份野生大麦材料,于2010年在以色列Atlit的Aaronson农场温室种植,旨在探究植物适应不同环境的进化基础,尤其是生殖阶段对干旱的响应机制。...
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  • DMY_Based_RNA_Seq与small_RNA_Seq处理文件及分析代码数据

    2026年1月18日 30 94 56

    数据集概述 本数据集包含DMY相关RNA-Seq和small RNA-Seq的处理文件与分析代码,涉及基因与miRNA的计数、表达量(FPKM/RPM)、差异分析结果及可视化脚本等,支持生物医学领域基因表达相关研究,共15个文件。 文件详解 基因表达数据文件...
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  • Human_seminal_EVs_Based_人精浆外泌体调控子宫内膜容受性研究数据

    2026年1月14日 30 175 114

    数据集概述 本数据集围绕人精浆外泌体(EVs)对子宫内膜容受性的调控作用展开,重点研究高密度外泌体(EV-H)通过白血病抑制因子(LIF)通路的影响机制。包含RNA-Seq相关补充数据及说明文档,可用于分析EV-H处理后子宫内膜细胞的差异表达基因及信号通路变化,为男性生育力相关研究提供支持。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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  • E_MTAB_6422_PRJEB24664_Based拟南芥生命周期基因表达图谱数据

    2026年1月14日 30 99 6

    数据集概述 本数据集为拟南芥(Col-0生态型野生型)全生命周期基因表达图谱,基于RNA-Seq技术构建36个基因表达文库,覆盖幼苗、莲座叶、根、花序、花、果实荚、种子等组织部位,以及2叶期、6叶期、12叶期、衰老期等发育阶段,每个组织和发育阶段包含3个生物学重复,记录了不同年龄样本的转录程序特征。 文件详解...
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  • Galaxy_Training_Network_JBrowse基因组数据可视化教程数据集

    2026年1月13日 30 40 9

    数据集概述 本数据集是Galaxy Training Network中JBrowse基因组数据可视化教程的配套数据,包含10个不同类型的基因组相关文件,覆盖DNA测序、RNA-Seq、基因注释、变异数据等内容,用于支持JBrowse工具的可视化操作训练与实践。 文件详解 基因组序列文件 文件名称:genome.fa 文件格式:FA...
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  • Apoditrysia_Based_鳞翅目高级蛾类RNA_Seq系统发育探索研究数据2013

    2026年1月12日 30 103 6

    数据集概述 本数据集为鳞翅目高级蛾类(Apoditrysia)系统发育研究的RNA-Seq数据,包含46个分类单元(40个Apoditrysia类群+4个外类群+2个已发表类群)的1579个直系同源基因序列,用于探索下一代测序技术对该类群系统发育关系的解析能力,核心为741个严格过滤后的基因矩阵及对比用19基因矩阵。 文件详解 说明文档...
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  • Daucus_carota_L_RNA_Seq_Based_胡萝卜花青素生物合成转录因子基因识别数据

    2026年1月5日 30 70 32

    数据集概述 本数据集基于RNA-Seq技术,针对胡萝卜花青素生物合成相关的转录因子基因进行识别研究。通过分析不同颜色愈伤组织及黑胡萝卜品种主根发育过程中的基因表达水平,筛选出与花青素含量显著相关的MYB、bHLH和WD40基因,为胡萝卜花青素合成调控机制研究提供数据支持。 文件详解...
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  • Capsella_bursa_pastoris_Based_群体结构对基因表达及开花时间变异影响研究数据

    2026年1月1日 30 192 103

    数据集概述 本数据集围绕杂草Capsella bursa-pastoris展开,聚焦群体结构对基因表达及开花时间变异的影响。通过RNA-Seq分析24份材料的基因表达差异,结合GBS基因分型数据,探讨群体遗传结构对表型差异解读的干扰,以及适应性性状与群体结构的关联,为植物适应性进化研究提供数据支撑。 文件详解 Cbp_RNA-...
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  • Kallisto_v0_50_版本基于_P_parvum_12B1_菌株的昼夜相_RNA_去除_RNA_Seq_表达量定量数据

    2025年12月27日 30 75 3

    数据集概述 本数据集是使用Kallisto v0.50.0对P. parvum 12B1株昼夜相rRNA去除RNA-...
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  • 间歇性铅暴露对人类大脑进化影响的RNA_Seq分析管道数据集

    2025年12月23日 30 11 6

    数据集概述 本数据集包含用于研究“间歇性铅暴露对人类大脑进化影响”的批量及单细胞RNA-Seq数据分析管道,对应JB等人发表于《Science Advances》的研究论文,提供了从数据处理到结果可视化的完整代码与辅助文件。 文件详解 代码文件(.r、.sh格式):共26个,含RNA-...
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  • 路易斯安那州立大学2022年生物信息学研讨会课程材料

    2025年12月19日 30 17 10

    数据集概述 本数据集为2022年路易斯安那州立大学生物信息学研讨会课程材料,围绕桡足类动物盐度胁迫下的RNA-Seq数据分析展开,包含实验流程、数据分析工具使用及相关示例文件,供学员学习生物信息学分析方法。 文件详解 文档类文件(PDF格式,共9个):...
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  • 病毒特征识别RNA_Seq数据集_ViTrace

    2025年12月19日 30 184 56

    数据集概述 该数据集包含用于评估ViTrace模型的三个模拟数据集(Sim1、Sim2、Sim3)和一个小鼠数据集,覆盖病毒、细菌、真菌等微生物序列,用于训练和测试病毒特征识别算法,支持肿瘤转录组中病毒信号的研究。 文件详解 该数据集包含4个压缩文件,具体说明如下: - Sim1.zip:...
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