北部安第斯被子植物辐射起源与非花性状演化研究数据集

数据集概述

本数据集为Ashokan等2025年发表的研究提供支撑,包含RAxML串联序列分析的输入、运行及结果文件,以及时间树校准分析的R代码与输出文件,用于探究北部安第斯被子植物辐射起源与非花性状演化。

文件详解

该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 目录: Data for Climbing higher exploring Northern Andean/ - 子目录: n138_RAxML_concatenated_seqs_1per_nopart_GTRG_b100/ - 文件示例: RAxML_info.raxml_out(RAxML分析信息文件)、concat_seqs_n138_partitions.nex(序列分区文件)、RAxML_bestTree.raxml_out(最优树结果文件)等,包含串联最大似然树分析的输入、运行脚本及结果文件。 - 子目录: n138_RAxML_trees_and_R_timetree_analysis_code-files/ - 文件示例: Burmeistera_timetree_results_Jan2022.xlsx(时间树结果Excel文件)、besttree_and_timetree_analysis.r(R分析代码文件)、RAxML_bipartitions.raxml_out.tre(树结构文件)等,包含时间树校准分析的R代码、输入树文件及输出结果。

适用场景

  • 生物地理学研究: 分析北部安第斯被子植物的起源与辐射演化历史
  • 系统发育学分析: 探究串联序列数据构建最大似然树的方法与应用
  • 性状演化研究: 结合时间树分析非花性状的演化模式
  • 生物信息学方法验证: 复现RAxML与R语言时间树校准的分析流程
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 42.57 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。