找到25个数据集

标签: phy

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  • Integrative_Based_Heuchera_longiflora物种分化研究数据

    2026年1月12日 30 204 64

    数据集概述 本数据集为Heuchera longiflora物种分化研究的整合分析数据,包含56个种群的7个分子标记及12个代表性种群的277个核标记数据,通过Sanger测序和NGS技术结合形态学数据,识别该物种的初始谱系,为种下分类单元界定提供证据支持。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,6个文件)...
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  • Habronattus_Salticidae_Based跳蛛物种复合体渐渗杂交进化影响研究数据

    2026年1月11日 0 108 38

    数据集概述 本数据集聚焦跳蛛Habronattus americanus物种复合体,探究渐渗杂交对其进化的影响。通过RADseq、超保守元件(UCEs)及形态学数据,分析基因组与形态的进化模式,揭示快速辐射与频繁渐渗导致的网状进化历史,包含267个文件,以基因序列数据为主。 文件详解 基因序列文件...
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  • Grallaria_hypoleuca_Based_安第斯山脉蚁鸫物种形成历史研究数据_原始序列与系统发育文件

    2025年12月28日 30 6 1

    数据集概述 本数据集为安第斯山脉“湾背蚁鸫”复合体(Grallaria hypoleuca s. l.)物种形成历史研究的序列数据与系统发育分析结果,包含线粒体DNA与GBS技术生成的短读序列,以及系统发育树、基因分型等文件,共16个文件,用于解析该鸟类类群的地理分化历史与演化过程。 文件详解 系统发育树文件(.tree、.trees格式)...
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  • 系统地理学研究数据集_西方鲤鱼棒鲈_Hypseleotris_klunzingeri_的系统发育地理学研究数据集

    2025年12月27日 30 82 54

    数据集概述 本数据集包含支持论文《澳大利亚广泛分布淡水鱼西方鲤鱼棒鲈(Eleotridae: Hypseleotris klunzingeri)的系统地理学:隐存种、杂交带与强种内分化》的基因组、同工酶和mtDNA数据集及分析文件,由Unmack等人提交至PeerJ期刊,共6个文件,涵盖原始与过滤后的数据格式。 文件详解 .phy格式文件(3个)...
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  • 苜蓿属基因组系统发育信号变异数据集

    2025年12月23日 30 41 14

    数据集概述 该数据集包含29种苜蓿属(豆科)植物的全基因组序列数据,通过与蒺藜苜蓿参考基因组比对,获得八万七千五百九十六个可变同源位点。用于解析苜蓿属内系统发育关系、评估不同位点数量的系统发育信号强度,以及识别与全基因组系统发育冲突的基因组区域。 文件详解 该数据集包含12个文件,具体说明如下: - 系统发育数据文件(.phy格式,共9个): -...
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  • 真菌与兰花间古老线粒体基因转移数据集

    2025年12月20日 30 202 39

    数据集概述 本数据集记录真菌与兰花祖先线粒体基因组间的水平基因转移(HGT)证据,包含首个真菌与被子植物线粒体基因组大规模HGT的研究数据,涉及基因序列比对、blast分析结果等,为古老跨物种基因转移研究提供支持。 文件详解 文档类文件: NCBI...
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  • 马达加斯加西北部侏儒壁虎分子系统学与新物种描述数据集

    2025年12月18日 30 175 134

    数据集概述 本数据集为论文《马达加斯加西北部神秘侏儒壁虎Lygodactylus ornatus的分子系统学及L. verticillatus群新物种描述》的配套数据,包含原始DNA比对及系统发育树文件,支持对该区域侏儒壁虎物种分类与进化关系的研究。 文件详解...
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  • 龟类与鳄类进化隔离及威胁的系统发育与空间分布数据集

    2025年12月18日 30 134 76

    数据集概述 该数据集围绕龟类与鳄类的进化隔离、威胁状态及系统发育特征展开,结合分子、形态学证据与机器学习算法,评估现存物种的多样化、威胁等级及进化独特性,预测未评估物种的威胁风险并识别高威胁区域。 文件详解 该数据集包含9个文件,具体说明如下: - 文档类文件: -...
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  • 真兽类配子识别基因快速分化促进宏观进化数据集

    2025年12月16日 30 203 109

    数据集概述 本数据集围绕真兽类配子识别基因(Zan)的快速分化展开,包含17个真兽目112个物种的基因序列及系统发育树文件,用于探究Zan基因在物种分化和真兽类适应性辐射中的作用。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共40个): 示例文件:Zan.con.tre、izumo1.nex.con.tre、adam2.nex.con.tre等...
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  • 矾根属系统发育基因组冲突数据集

    2025年12月13日 30 191 145

    数据集概述 本数据集围绕矾根属(Heuchera)的系统发育基因组冲突展开,整合了核基因、质体和线粒体三类独立基因组数据,通过多种分析策略揭示物种杂交导致的系统发育不一致现象,为植物进化研究提供多维度数据支持。 文件详解 该数据集包含53个文件,涵盖多种格式,具体说明如下: - 附录与统计文件: - Appendix1_Coverage...
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  • 北美树花属_梅衣科_分子研究数据集

    2025年12月13日 30 30 29

    数据集概述 本数据集聚焦北美树花属(Alectoria)地衣的分子系统发育研究,通过ITS和Mcm7两个核基因分析9个类群的48个样本,探讨5个与A. sarmentosa相关或易混淆类群的分类界限,提出临时分类处理建议及新物种组合,并提供北美树花属物种检索表。 文件详解...
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  • Fascicularia_Ochagavia组系统基因组学研究数据集2020

    2025年12月10日 30 98 22

    数据集概述 该数据集包含Paule等人2020年发表的关于凤梨科Fascicularia-Ochagavia组系统基因组学研究的相关数据,主要涵盖DNA序列比对文件、系统发育分析的数据分区方案输入输出文件等,为该类群的系统发育研究提供基础数据支持。 文件详解 DNA序列比对文件: rDNA.phy、cp-dataset-2_coding.phy、cp-...
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  • 两栖动物生物地理分析数据集

    2025年12月9日 30 162 24

    数据集概述 本数据集包含两栖动物生物地理分析的相关数据,基于3309个物种(约占现存多样性的45%)的时间树,重建其在12个全球生态区的迁徙模式,探讨古代大陆 vicariance 和近期海洋扩散对现存物种分布的影响。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 核心数据文件: - amph_shl_dates_trim.tre:...
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  • 海链藻目海陆生境转换时间推断数据集

    2025年12月8日 30 25 6

    数据集概述 该数据集围绕海链藻目(Thalassiosirales)的海陆生境转换时间展开研究,通过贝叶斯松弛分子钟方法分析不同化石校准方案下的演化时间尺度,探讨淡水谱系的起源时间及主要生境殖民事件的发生时期。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共7个):...
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  • 百岁兰蝽宿主植物转换与肠道微生物群关联数据集

    2025年12月7日 30 39 26

    数据集概述 本数据集围绕百岁兰蝽从被子植物向裸子植物(百岁兰)宿主转换的适应性机制展开,包含其肠道微生物群落(细菌、真菌)的测序数据、实验室发育实验结果及微生物系统发育分析文件,为研究昆虫适应极端环境新宿主的微生物驱动机制提供数据支持。 文件详解...
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  • 新世界鼠尾草系统发育基因组矩阵与分区文件数据集

    2025年11月30日 30 102 58

    数据集概述 本数据集包含一篇关于新世界鼠尾草(Salvia subgenus Calosphace)植物锚定杂交富集方法试点研究的系统发育基因组数据,涵盖未过滤和过滤的矩阵文件及分区文件,还包括用于数据过滤的R脚本,共十六个文件,存储于一个目录下。 文件详解 该数据集包含一个目录及其中的文件,具体说明如下: - 主目录: Phylogenomic...
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  • 环带环节动物NaK基因复制数据集

    2025年11月30日 30 16 12

    数据集概述 本数据集包含环带环节动物NaK基因复制研究相关的生物信息学数据文件与分析脚本,用于支持相关学术出版物的研究工作,涵盖物种序列数据、系统发育分析配置及数据处理代码。 文件详解 系统发育分析数据文件(.phy格式):...
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  • 西方蜜蜂线粒体基因组进化历史分析数据集

    2025年11月29日 30 183 114

    数据集概述 本数据集围绕西方蜜蜂(Apis mellifera)线粒体基因组展开,通过分析十八个亚种的完整线粒体基因组,探究其进化与生物地理历史,支持其起源于北非或中东的结论,为蜜蜂系统发育研究提供数据支持。 文件详解 该数据集按不同分析路径分类存储,包含序列数据、系统发育分析输入文件及结果文件,具体如下: - 序列数据文件(.phy格式): -...
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  • 北美沙漠福桂树属近期辐射分化与扩散数据集

    2025年11月28日 30 6 5

    数据集概述 该数据集聚焦北美沙漠中福桂树属(Fouquieria)的近期辐射分化与扩散研究,包含用于系统发育分析的DNA序列数据矩阵及分区文件,支持对这一古老植物类群演化历史的探究。 文件详解 该数据集包含4个文件,具体说明如下: - 核心序列文件: -...
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  • 臭虫科营养共生体重复获取分析数据集

    2025年11月28日 30 153 0

    数据集概述 该数据集聚焦臭虫科(Cimicidae)相关共生细菌的系统发育研究,包含重建共生体共进化历史及代谢依赖关系的基础数据,通过多类共生菌的系统发育文件为相关分析提供支持。 文件详解 文件名称及格式:数据集包含5个.phy格式文件,具体为: Cimicidae_def.phy:臭虫科系统发育数据文件...
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