数据集概述
该数据集围绕北美奶蛇（Lampropeltis triangulum复合体）的生态分化与基因流历史展开，通过基因组数据和建模方法分析物种形成机制、杂交区位置及基因渐渗模式，验证基于小数据集界定的三个类群（L. elapsoides、L. triangulum、L. gentilis）的物种有效性，揭示大平原与东部北美森林栖息地变化对物种分化的影响。
文件详解
该数据集包含多种类型文件，具体说明如下：
- 样本与地理信息文件:
- Data.D1._List_of_samples_and_localities_used_for_this_research.xlsx: Excel格式，记录研究使用的样本列表及地理信息
- Data._D4.5.Localities_New.txt: TXT格式，包含物种样本的纬度（Lat）、经度（Lon）等地理坐标数据
- 基因组原始数据文件:
- Data._D2._Fasta_files_generated_for_Lampropeltis_triangulum_L._gentilis_and_L._elapsoides_from_ipyrad..zip: ZIP压缩包，存储由ipyrad生成的FASTA格式基因组序列文件
- Data._D3._VCF_file_generated_for_Lampropeltis_triangulum_L._gentilis_and_L._elapsoides_from_ipyrad.vcf: VCF格式，ipyrad生成的基因组变异数据文件
- 分析代码与参数文件:
- Data._D4._R_Code.R: R语言格式，数据分析代码文件
- Data._D5._Priors.xlsx: Excel格式，建模分析使用的先验参数文件
- 结果图表文件:
- 共8个PDF格式图表文件，包括Fig.S1.PM_Models.pdf（PM模型图）、Fig.S3_DAPC_Pulled.pdf（DAPC分析图）、Fig.S5_Souther_Admix.pdf（遗传混合分析图）、Fig.S6_PCs.pdf（主成分分析图）等
适用场景
- 进化生物学研究: 分析爬行动物物种形成过程中的生态驱动机制
- 生物地理学分析: 探究大平原与东部北美森林过渡带的物种分化模式
- 基因组学研究: 验证基于小数据集界定的物种有效性及基因流历史
- 保护生物学应用: 为北美奶蛇类群的分类与保护策略制定提供数据支持
