本氏烟草CRISPR_SpCas9基因组编辑量化原始扩增子测序数据集

数据集概述

该数据集包含CRISPR/SpCas9系统在本氏烟草中产生基因组编辑的原始扩增子测序（AmpSeq）数据，是植物基因组编辑量化方法基准研究的一部分，通过Illumina MiSeq双端150bp测序生成，用于编辑效率的基准量化分析。

文件详解

• 文件名称: AmpSeq Pair End Fastq.zip
• 文件格式: ZIP（压缩包）
• 文件内容: 包含本氏烟草CRISPR编辑实验的原始双端扩增子测序Fastq文件，部分样本为混合测序后拆分并标记对应gRNA及样本ID的重复文件

适用场景

• 植物基因组编辑技术研究: 用于验证和优化CRISPR/SpCas9系统在烟草中的编辑效率
• 测序数据分析方法开发: 作为基准数据评估扩增子测序数据的比对、拆分及编辑量化算法
• 分子生物学实验设计: 为植物瞬时转化及多gRNA并行实验提供数据参考
• 基因组编辑量化方法对比: 支持不同编辑检测方法（如AmpSeq与其他8种方法）的性能差异分析