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被子植物的重组率与基因组进化研究数据
2026年2月15日 30 48 37
数据集概述 本数据集围绕被子植物重组率、基因组结构与分子进化的关系展开,包含3个文件,用于研究植物重组率对基因组大小、基因家族演化及分子选择压力的影响。数据支持系统发育比较分析,可揭示重组率在植物基因组宏观进化中的作用。 文件详解 matK_opt.mf.fasta 文件格式:FASTA...
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Solidago_Based植物标本基因组测序与物种信号分析数据
2026年2月9日 30 126 118
数据集概述 本数据集为Solidago属(菊科)植物标本基因组测序研究成果,通过对1970-2010年采集的95份标本进行基因分型测序,结合UNEAK流程处理获得单核苷酸多态性(SNP)数据,用于评估标本基因组在物种界定与系统发育中的应用价值,共包含20个文件。 文件详解 数据处理配置文件(XML格式)...
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RfCTD_Based_植物线粒体Rf蛋白分子功能研究数据集
2026年1月29日 30 129 93
数据集概述 本数据集围绕植物线粒体中育性恢复(Rf)蛋白的分子功能展开,包含213个植物基因组中识别出的PPR基因信息,以及用于区分Rf类(RFL)蛋白的独特C端结构域(RfCTD)相关分析结果,可支持植物Rf蛋白的快速识别与功能研究。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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Penstemon_MAKER2_Based基因预测注释与标记开发数据
2026年1月26日 30 54 14
数据集概述 本数据集是针对北美特有植物Penstemon属的基因预测与注释结果,通过MAKER2注释流程从6个极低覆盖度(约0.005×−0.007×)基因组中识别基因区域,支持系统发育标记开发。包含基因注释文件、序列文件等5个文件,可用于下游引物设计及序列分化分析。 文件详解 文件名称:Penstemon-MAKER-FuncAnnots.xlsx...
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NOVOWrap_Based_质体基因组组装与结构标准化软件测试数据
2026年1月23日 30 53 17
数据集概述 本数据集为质体基因组组装工具NOVOWrap的测试数据,包含该软件在11种植物(石松类、裸子植物、被子植物)上的基准测试结果,涉及组装结果验证、注释、模块性能评估等内容,支持研究者验证软件功能及获取标准化基因组数据。 文件详解...
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Polyploidy_Database_多倍体植物物种形成速率研究数据
2026年1月23日 30 165 97
数据集概述 本数据集围绕多倍体植物的宏观进化影响展开,包含数百个多倍化事件的分析结果,验证了多倍体植物相较于二倍体植物具有更低的物种形成速率和更高的灭绝速率的结论。数据集包含2个文件,涵盖植物多倍体演化速率相关的数据库及说明文档。 文件详解 README_for_polyploidy_database.txt 文件格式:TXT...
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Boechera_stricta_Based_基因组变异进化机制研究数据
2026年1月22日 30 160 154
数据集概述 本数据集基于517份Boechera stricta全基因组重测序数据,研究其基因组变异的进化机制,识别出长期平衡选择和古老多态性分化分选驱动的遗传多样性与群体分化特征,包含基因组变异数据、样本地理信息及分析脚本三类文件。 文件详解 Boechera_stricta.snp.gz 文件格式:GZ 字段映射介绍:Boechera...
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InpactorDB_Based_LTR反转录转座子检测阴性实例原始数据
2026年1月22日 30 198 27
数据集概述 本数据集包含植物基因组中除LTR反转录转座子(LTR_RTs)外的其他基因组特征序列,作为机器学习检测LTR_RTs的阴性实例。数据来源于InpactorDB及多个植物基因组数据库,涵盖编码序列、各类RNA及非LTR类转座元件,为相关模型训练提供负样本支持。 文件详解 文件名称:negative_instances_raw.zip...
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DRYAD_Based_Frangula_alnus环境选择基因组特征数据
2026年1月21日 30 5 1
数据集概述 本数据集围绕广泛分布的虫媒树种Frangula alnus subsp. alnus(鼠李科),筛选25个原生种群的183个注释单核苷酸多态性(SNPs),结合种群基因组离群分析、个体及多变量景观基因组方法,研究环境选择对基因组变异的影响及驱动选择的关键环境因子,为种群响应环境线索的能力提供基础见解。 文件详解...
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Senecio_Based_生态物种形成驱动的形态分化与生殖隔离基因组数据
2026年1月21日 30 110 19
数据集概述 本数据集聚焦千里光属(Senecio)物种生态物种形成过程,包含其基因组分化、形态差异及生殖隔离的遗传基础相关数据。涉及约20万年内因埃特纳火山隆起驱动分化的近缘物种,记录了高密度遗传图谱、杂交衰退QTL位点、分化选择区域及传递率失真区域等关键信息,为研究植物生态物种形成机制提供支撑。 文件详解...
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乌里韦_康弗斯和坦克_2015_基于植物类群系统发育与生物地理学研究数据的论文
2026年1月20日 30 78 58
数据集概述 本数据集来自植物学研究,聚焦Orobanchaceae科Rhinantheae类群的系统发育关系、分化动态及历史生物地理学,特别关注安第斯山脉Bartsia属类群的近期辐射演化。数据集包含分子矩阵等分析数据,用于验证生物地理迁移与分化速率变化的关联,共2个文件。 文件详解 文件名称:README_for_Uribe-...
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in_silico_PCR_Based_植物基因组Athos_MITE元件分析结果数据
2026年1月14日 30 146 17
数据集概述 本数据集为使用Java工具进行硅片PCR分析的结果,针对多种完整植物基因组(如大麦、小麦等),以大麦-小麦Athos微型反向重复转座元件(MITE)的反向重复序列引物列表为基础,识别含两端重复的完整Athos及相关MITE元件,结果体现为表格形式,包含元件数量、基因组匹配情况等核心信息。 文件详解 文件名称:Result.zip...
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Dryad_Source_Solanaceae科R2R3_MYB转录因子多样化研究数据
2026年1月14日 30 183 139
数据集概述 本数据集围绕茄科(Solanaceae)植物R2R3-MYB转录因子的多样化展开,包含基于4种茄科植物全基因组数据鉴定的559个R2R3-MYB基因信息,以及其与拟南芥同源基因的进化关系重建、功能多样性比较结果,支撑茄科转录因子家族进化及功能分化研究。 文件详解 文件名称:Dryad.zip 文件格式:ZIP...
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Citrus_Supplementary_柑橘属物种染色质可及性与序列分化研究补充表格数据
2026年1月13日 30 1 0
数据集概述 本数据集为论文第二章“柑橘属物种间染色质可及性的谱系特异性变化与序列分化相关”的补充表格,包含1个Excel文件,记录了支持该章节研究结论的相关数据,是研究柑橘属物种表观遗传差异与序列演化关系的辅助资料。 文件详解 文件名称:Chapter2_Tables.xlsx 文件格式:XLSX...
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本氏烟草CRISPR_SpCas9基因组编辑量化原始扩增子测序数据集
2025年12月23日 30 157 27
数据集概述 该数据集包含CRISPR/SpCas9系统在本氏烟草中产生基因组编辑的原始扩增子测序(AmpSeq)数据,是植物基因组编辑量化方法基准研究的一部分,通过Illumina MiSeq双端150bp测序生成,用于编辑效率的基准量化分析。 文件详解 文件名称: AmpSeq Pair End Fastq.zip 文件格式: ZIP(压缩包)...
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Polylepis属物种基因组大小染色体数目及保卫细胞大小数据表
2025年12月23日 30 207 202
数据集概述 本数据集为Polylepis属(蔷薇科)物种的基因组大小、染色体数目、保卫细胞长度及推测倍性水平的汇总表,包含多个物种的测量数据、凭证标本/采集地信息及文献来源标注,为该属物种的细胞学研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:Table 2 in A monograph of the genus Polylepis (Rosaceae)...
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植物基因组工作凭证与组织采集指南补充材料2017
2025年12月19日 30 38 6
数据集概述 该数据集为2017年发布的植物基因组工作凭证与组织采集指南的补充材料,包含常用资源来源信息,以PDF文档形式提供,支持植物基因组研究相关的凭证与组织采集实践。 文件详解 文件名称:oo_116040.pdf 文件格式:PDF...
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人参属植物叶绿体DNA条形码与全基因组NCBI登录号补充材料
2025年12月18日 30 123 71
数据集概述 本数据集为研究人参属植物叶绿体DNA条形码物种鉴别及应用的补充材料,包含研究所用DNA条形码序列和全叶绿体基因组的NCBI登录号,支持对人参属植物物种鉴定方法的验证与复现。 文件详解 文件名称: oo_631059.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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植物微外显子数据库数据集
2025年12月15日 30 162 24
数据集概述 该数据集为植物微外显子数据库(MEPDB)的全部数据压缩包,收录了132种植物中的20,224个微外显子(长度小于51核苷酸的外显子)信息,可提供植物微外显子的全面数据支持。 文件详解 文件名称:MEPDB_all_data.zip 文件格式:ZIP压缩包...
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植物基因组大小介导物种和群落对降水变化及氮富集响应数据集
2025年12月12日 30 108 91
数据集概述 本数据集围绕植物基因组大小(GS)与物种生态策略的关联展开,通过半干旱草原的降水梯度与氮添加实验,探究GS在介导物种对环境变化响应及群落动态中的作用,为理解基因组特征与生态过程的关系提供数据支持。 文件详解 数据集压缩包: 文件名称: dataset.zip 文件格式: ZIP(压缩文件) 内容说明:...



