数据集概述
本数据集是论文“Beyond Volume: Unraveling the Genetics of Human Brain Geometry”的补充数据与代码,包含FUMA SNP-to-Gene输出结果、质量控制、拉普拉斯-贝尔特拉米计算、GWAS及后GWAS分析、不对称性PCA、CCA、遗传性分析、重复验证等相关代码,以及示例脚本和使用的归档包及其许可证,共12个文件。
文件详解
- 许可证文件(License files)
- 文件名称:license_pops.txt、license_mostest_gpl.txt、license_brainprint.txt、license_mostest_bsd.txt、license_fastman.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含各工具包对应的开源许可证内容,如GNU GENERAL PUBLIC LICENSE等。
- 代码归档包(Code archives)
- 文件名称:code.tar.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:包含质量控制、拉普拉斯-贝尔特拉米计算、GWAS及后GWAS分析等分析流程的代码。
- 工具包归档包(Tool archives)
- 文件名称:SCORE-master.zip、mostest-master.zip、fastman.tar.gz、pops-master.zip、BrainPrint.tar.gz
- 文件格式:ZIP、GZ
- 字段映射介绍:包含研究中使用的各类工具包源码及相关文件。
- 分析结果归档包(Analysis result archive)
- 文件名称:FUMA_results.tar.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:包含FUMA SNP-to-Gene分析的输出结果。
数据来源
论文“Beyond Volume: Unraveling the Genetics of Human Brain Geometry”
适用场景
- 人类大脑几何遗传学研究: 利用GWAS及后GWAS分析代码与FUMA结果,探究大脑几何结构的遗传机制。
- 生物信息学分析流程复现: 通过示例脚本和代码包,复现研究中的质量控制、拉普拉斯-贝尔特拉米计算等分析步骤。
- 大脑不对称性与遗传性分析: 使用PCA不对称性分析、CCA及遗传性分析代码,研究大脑结构不对称性的遗传基础。
- 开源工具包应用参考: 基于提供的归档工具包及其许可证,参考相关工具在大脑几何遗传学研究中的应用方法。