表型基因嵌入向量分析数据集_Phenotype_Gene_Embedding_Vector_Analysis_Dataset
数据来源:互联网公开数据
标签:基因组学, 表型, 嵌入向量, 文本分析, 机器学习, 生物信息学, 知识图谱, 自然语言处理
数据概述:
该数据集包含来自公开生物医学数据库的数据,记录了表型和基因的嵌入向量,以及对应的描述信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态数据集。
地理范围:数据来源于全球生物医学研究,未限定具体地理范围。
数据维度:
* gene_embeddings.csv:基因的嵌入向量。
* phenotype_embeddings.csv:表型的嵌入向量,包含“Unnamed: 0”(索引)、“0”(表型名称)、“gpt_description”(GPT生成的表型描述)和“embedding”(嵌入向量)字段。
* opentargets_step2.for_llm.tsv:用于LLM(大型语言模型)处理的中间数据。
* opentargets_step2.labels:标签数据。
数据格式:数据以CSV和TSV格式提供,便于数据分析和模型训练。数据来源包括公开的生物医学知识库,并经过预处理。
该数据集适合用于基因与表型关联分析、生物医学文本分析和知识图谱构建等领域。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、计算生物学等领域的学术研究,如基因功能预测、疾病相关基因识别、表型语义分析等。
行业应用:可为生物制药、精准医疗等行业提供数据支持,尤其在药物靶点发现、疾病诊断、个性化治疗方案制定等方面具有潜在价值。
决策支持:支持生物医学研究领域的决策制定和数据驱动的策略优化。
教育和培训:可作为生物信息学、机器学习等相关课程的实践数据集,帮助学生和研究人员深入理解基因与表型之间的关系。
此数据集特别适合用于探索基因与表型之间的复杂关联,构建预测模型,并提升对生物医学现象的理解。