数据集 - 海数据

APTE_Source_植物转座元件图谱辅助支持数据

2026年1月31日 30 29 8

数据集概述本数据集是论文《An Atlas of Plant Transposable Elements》的支持数据，包含辅助材料数据和代码软件说明两部分，用于支撑植物转座元件图谱的研究工作。数据集共包含2个文件，分别为基因组参考信息表格和转座元件注释步骤文档。文件详解辅助材料数据文件名称：SuppMat_1.xlsx 文件格式：XLSX...

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GIDS_Based_多分类表型基因互作检测研究数据

2026年1月31日 30 17 8

数据集概述本数据集为多分类表型基因互作检测方法研究的配套数据，包含基于广义差异指数（GIDS）的方法实现文件、两类模拟研究数据及韩国KARE项目真实GWAS数据。数据用于验证GIDS方法在多分类表型基因互作检测中的性能，支持基因关联研究中多分类表型分析方法的开发与评估。文件详解 GIDS.zip 文件格式：ZIP...

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AMAS_Based_大序列比对操作与统计计算工具数据

2026年1月31日 30 90 9

数据集概述本数据集包含AMAS工具相关数据，AMAS是一款用于大型序列比对操作和统计计算的工具，适用于氨基酸和核苷酸比对，支持格式转换、序列拼接、位点提取等操作，可计算序列数量、比对长度、缺失数据比例等统计量，适用于大规模系统发育研究。文件详解文件名称：Suppl_alns.zip 文件格式：ZIP...

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ASTRAL_Source_基因组规模物种树估计数据集

2026年1月31日 30 114 60

数据集概述本数据集为ASTRAL方法（一种基于多物种溯祖模型的基因组规模物种树估计方法）相关的研究数据，包含模拟与生物学数据集，用于支持物种树估计的准确性验证与方法比较，共6个文件，涵盖说明文档、真实树、模拟脚本、序列数据、估计基因树及生物学数据等类型。文件详解文件名称：README.md 文件格式：MD...

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Ophiuroidea_海洋生物多样性_系统发育与分布数据

2026年1月30日 0 95 14

数据集概述本数据集整合了南半球从海面到深渊、赤道到极地的蛇尾纲（Ophiuroidea）无脊椎动物的系统发育基因组学与分布数据，首次对比分析浅海（0-200米）和深海（>200米）蛇尾纲系统发育多样性的演化过程，揭示不同海域纬度多样性梯度的形成机制，包含6个文件。文件详解 Bathome_ReadMe_v1.docx 文件格式：DOCX...

PRAD_Based_前列腺癌突变与拷贝数特征分析补充数据

2026年1月30日 30 100 20

数据集概述本数据集为论文“Copy number signature analysis tool and its application in prostate cancer reveals distinct mutational processes and clinical...

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Oryctolagus_cuniculus_DATASET

2026年1月29日 30 32 7

数据集概述本数据集包含Oryctolagus cuniculus（穴兔）的基因型数据文件，采用PED和MAP格式，可通过PLINK、GCTA等工具进行管理和分析，共包含2个文件，无目录结构。文件详解文件名称：Oryctolagus cuniculus DATASET.docx 文件格式：docx...

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TG_GATEs_Based毒理基因组学项目化学物质列表数据

2026年1月29日 30 203 73

数据集概述本数据集包含从毒理基因组学项目辅助毒性评估系统（TG-GATEs）获取的化学物质列表，总计包含一个文件，可用于毒理研究相关的化学物质信息查询与分析。文件详解文件名称：tg_gates.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：文件为TG-...

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temporal_genomics_全球变化进化响应研究数据

2026年1月29日 30 67 7

数据集概述本数据集是关于时间基因组学在全球变化进化响应研究中的系统性文献综述数据。它整合了近200年人类活动加速背景下的进化过程研究文献，包含文献筛选结果、进化指标数据及研究设计指南，为相关研究提供结构化参考，共含12个文件。文件详解数据文件（.csv格式，共8个）...

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枯叶树DRYAD在大肠杆菌长期进化实验中的核心基因快速进化研究

2026年1月29日 30 119 98

数据集概述本数据集围绕大肠杆菌长期进化实验（LTEE）展开，分析核心基因的进化特征。包含60株大肠杆菌共有的约2000个核心基因，对比其在实验中的突变情况与自然环境中的保守性，发现核心基因在LTEE中积累更多非同义突变，且受正选择的核心基因在自然中更保守，部分适应性突变可修饰蛋白功能。文件详解文件名称：README_for_DRYAD-LTEE-...

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Bayesian_Based_多数量性状联合预测贝叶斯模型数据

2026年1月28日 30 210 8

数据集概述本数据集为贝叶斯多变量先行依赖模型联合预测多数量性状的研究数据，包含模拟数据及说明文档。通过模拟六种场景、每种场景重复30次生成数据，用于验证该模型在表型预测中的准确性与稳健性，支持基因组学领域的表型预测研究。文件详解 README_for_simulation_datasets.txt 文件格式：TXT...

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代谢组学引导的基因组比较研究_哺乳动物冬眠基因趋同进化数据分析

2026年1月28日 30 186 144

数据集概述本数据集配套“Genes Underlying Adaptive Physiological Shifts Among Hibernating Mammals”手稿，包含基因组、系统发育及功能富集数据，用于研究哺乳动物冬眠相关性状（尤其是肉碱代谢）的进化机制，覆盖物种树、基因树、功能富集等多类型资源。文件详解系统发育资源...

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PLEIO_example_GWAS多性状元分析工具教程示例数据

2026年1月28日 0 167 136

数据集概述本数据集包含运行PLEIO工具教程的示例文件。PLEIO是一款基于命令行的工具，用于利用多性状GWAS汇总统计数据进行元分析。数据集共3个文件，涵盖代码、输入列表及压缩数据，支持用户学习和测试该工具的使用流程。文件详解代码文件：文件名称：example.R 文件格式：.r...

Kahnplexity_for_DRYAD_食蚊鱼性选择实验数据

2026年1月28日 30 106 50

数据集概述本数据集为食蚊鱼（Gambusia holbrooki）性选择实验数据，通过操纵性比（OSR）和栖息地复杂度，直接测量雄性繁殖成功率（父权），量化对雄性体型、生殖器长度及杂合性的性选择强度，探究环境与社会因素对性选择一致性的影响，包含1个文件。文件详解文件名称：Kahnplexity_for_DRYAD.xlsx 文件格式：XLSX...

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hym_v2_Bait_Set_蚂蚁膜翅目基因组系统发育研究数据

2026年1月28日 30 87 61

数据集概述本数据集包含用于研究蚂蚁和膜翅目基因组系统发育的增强型UCE诱饵集及相关分析数据。通过优化UCE基因座识别和诱饵设计流程，新增2590个膜翅目UCE基因座，覆盖16/17蚂蚁亚科的84个分类群数据，验证了高捕获成功率，支持系统发育树构建，并整合传统标记生成综合蚂蚁系统发育数据。文件详解文件名称：appendix2-supporting-...

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Catharus_Based_鸫属隐存物种基因组数据集_2021

2026年1月28日 30 125 36

数据集概述本数据集聚焦鸫属（Catharus）鸟类的隐存物种形成基因组学研究，包含比氏夜鸫（C. bicknelli）、灰颊夜鸫（C. minimus）及斯温氏夜鸫（C. ustulatus）的参考基因组与种群重测序数据，以及相关分析结果。数据用于探究物种分化历史、遗传分化、基因组结构及适应性进化过程，共包含2个核心文件。文件详解...

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Neurospora_Based_RIP突变分析代码与文件数据集

2026年1月27日 0 15 7

数据集概述本数据集存储了Neurospora crassa RIP突变分析所用的代码与文件，涵盖基因组突变检测、甲基化定量、Sly1-1突变分析三部分内容，包含研究中使用的序列、注释等相关文件，用于支持该真菌RIP突变的系统性分析。文件详解压缩文件文件名称：zenodo_upload.zip 文件格式：ZIP...

Sendell_Price_Based银眼鸟形态分化基因组研究数据

2026年1月27日 30 15 11

数据集概述本数据集是关于人类介导引入后银眼鸟（Zosterops lateralis）形态快速分化的研究数据，通过RAD-Seq技术分析其基因组变异与表型变化的关联，探讨遗传漂变和定向选择在形态分化中的作用。数据包含相关研究的基因组和表型分析文件，支持对鸟类快速演化机制的研究。文件详解文件名称：Sendell-...

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Amblypygi_Based鞭蛛全球系统发育与DNA序列研究数据

2026年1月27日 30 12 9

数据集概述本数据集为鞭蛛（Amblypygi）全球系统发育研究相关数据，包含DNA序列比对、UCE序列比对及说明文档，支持鞭蛛分子系统发育分析、分化时间估算等研究，共5个文件，覆盖3种文件格式。文件详解 README.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、数据采集与处理方法、文件内容说明等信息...