数据集概述
该数据集包含丙酮丁醇梭菌钨依赖性醛：铁氧还蛋白氧化还原酶结构中的配体对接数据，通过Caver Web工具完成。数据涵盖多种配体（如乙酸、甲醛等）在不同隧道的对接结果，以PDBQT、PDB和PDF格式存储，为酶结构与配体相互作用研究提供支持。
文件详解
- 配体对接结果文件（PDBQT格式，16个）：
- 示例文件：Acetic_acid_tunnel_1.pdbqt、formaldehyde_tunnel_2.pdbqt等
- 内容：记录不同配体（如乙酸、甲醛、乙醛、丁醛、R-乙酰乙酸、乙酸盐）在隧道1或隧道2中的对接结构数据
- 结构与隧道文件（PDB格式，3个）：
- structure.pdb：酶的原始结构文件
- tunnel_1.pdb、tunnel_2.pdb：酶结构中两个隧道的结构数据
- 补充文档（PDF格式，1个）：
- Presentation_diffusion_profile_tunnel.pdf：可能包含隧道扩散剖面的展示文档
适用场景
- 酶结构功能研究：分析钨依赖性醛氧化还原酶与不同配体的结合模式
- 分子对接技术验证：验证Caver Web工具在酶隧道配体对接中的应用效果
- 代谢工程研究：为丙酮丁醇梭菌相关代谢途径改造提供分子相互作用数据
- 生物化学教学：作为酶-配体相互作用的案例数据，辅助教学演示
