数据集概述
本数据集为《Blommersia wittei复合体的整合修订:马达加斯加西部和西北部新蛙种描述》论文配套数据,包含原始序列比对、鸣声记录及序列与元数据表,共8个文件,用于支持蛙类物种复合体的分类学研究。
文件详解
- 序列比对文件(共5个)
- 文件名称:wittei_16S_MAFFTalignedGinsi_03March2023.fas、wittei_sacs_CUT.fas、witteiRAG1_CUT_PHASED2.fas、wittei_sacs_CUT_PHASED2.fas、witteiRAG1_CUT.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含蛙类物种的核苷酸序列比对数据,用于系统发育分析
- 补充表格文件(共2个)
- 文件名称:Vences_Blommersia_wittei_SupplTab01.xlsx、Vences_Blommersia_wittei_SupplTab02.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含序列元数据等补充信息,支持分类学研究的辅助分析
- 距离汇总文件(共1个)
- 文件名称:Blommersia_wittei_pairwise_distances_summary.tsv
- 文件格式:TSV
- 字段映射介绍:包含seqid(query 1)、seqid(query 2)、p、p-gaps、jc、k2p、ncd、species(query 1)、species(query 2)等字段,记录两两序列间的遗传距离及物种信息
数据来源
论文“Integrative revision of the Blommersia wittei complex, with description of a new species of frog from western and north-western Madagascar”(DOI: https://doi.org/10.11646/zootaxa.5319.2.2)
适用场景
- 蛙类分类学研究:用于Blommersia wittei复合体的物种界定与新种描述
- 分子系统发育分析:基于序列比对数据重建蛙类物种的进化关系
- 遗传距离分析:通过两两序列距离数据研究物种间的遗传分化程度
- 生物声学研究:结合鸣声记录分析蛙类物种的声学特征差异
- 生物多样性调查:支持马达加斯加蛙类物种分布与多样性评估