找到179个数据集

标签: 核苷酸序列

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  • 假单胞菌分类及毒力因子预测数据文件

    2026年2月15日 30 171 71

    数据集概述 本数据集包含用于丁香假单胞菌(Pseudomonas syringae)分类和毒力因子预测的16个文件,涵盖核心基因组树、分类元数据、QIIME 2分类器及毒力因子分析结果,可支持该菌种的分类鉴定、毒力因子检测及相关生物信息学研究。 文件详解 核心基因组树文件 文件名称:PSSC.tree.txt 文件格式:TXT...
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  • MHC_Based_猫科动物MHC微卫星标记开发与多样性评估数据

    2026年2月9日 30 106 4

    数据集概述 本数据集包含为家猫开发的MHC相关微卫星标记,以及利用这些标记评估家猫(澳大利亚混种和纯种缅甸猫)、猎豹和吉尔狮子MHC多样性的数据。数据涉及微卫星标记开发结果、不同猫科动物群体的MHC多样性分析,可用于研究猫科动物免疫遗传多样性与种群健康的关系,共包含4个文件。 文件详解 狮子MHC序列文件...
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  • 西非蛇类毒液的比较转录组学数据

    2026年2月12日 30 66 47

    数据集概述 本数据集包含西非特有Africonus和Varioconus属13种食虫芋螺毒液腺转录组测序结果及毒液库比较分析数据,基于系统发育框架研究芋螺毒素前体的多样性、共享性及进化特征,涉及毒素超家族组成、表达水平等核心内容。 文件详解 ReadMe.xlsx(XLSX格式):数据集说明文件,包含数据结构、文件用途及使用指引等信息...
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  • 水稻转录组中病毒多样性的深度分析数据集

    2026年2月9日 30 24 10

    数据集概述 本数据集基于17,115个水稻转录组RNA-seq文库,覆盖24个稻属物种及51个国家样本,通过从头组装和同源性方法鉴定出810个完整或近完整病毒,包括276种已知病毒和534种新型病毒。数据还包含病毒分类注释及与水稻密切相关的427种病毒筛选结果,为水稻病毒病防控提供新见解。 文件详解 压缩文件(Archive files)...
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  • 南极毛皮海狮皮肤转录组基因发现与标记数据

    2026年2月9日 30 27 23

    数据集概述 本数据集基于12只南极毛皮海狮皮肤活检样本的标准化cDNA文库,通过454测序生成超412Mb序列数据,包含156个contigs、22869个isotigs及18576个isogroups。数据覆盖多种功能基因,多数可映射至犬类基因组,支持海洋哺乳动物基因组资源开发,用于解决鳍足类生态与进化问题。 文件详解 Sequence...
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  • 斯堪的纳维亚棕熊基因结构变异与瓶颈事件研究

    2026年2月1日 30 203 186

    数据集概述 本数据集聚焦斯堪的纳维亚棕熊种群,通过线粒体和微卫星DNA标记,分析其经历百年前种群瓶颈后的遗传结构与变异特征。数据包含历史与现代样本的基因序列及微卫星数据,用于探究瓶颈效应对遗传多样性的影响,为该种群的保护管理提供科学依据。 文件详解 基因序列文件...
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  • 压抑对进化获益的影响及基因表达模式研究数据集

    2026年2月9日 30 78 75

    数据集概述 本数据集为论文“Repression precedes independent evolutionary gains of a highly specific gene expression pattern”的配套数据,包含系统发育树文件、基因位点文档、序列比对及分区文件等,共5个文件,用于支持基因表达模式进化机制的研究。 文件详解...
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  • 根霉属物种复合体对陆生兰花的系统性定殖数据

    2026年2月1日 30 152 106

    数据集概述 本数据集包含OTU表和代表性序列,用于支持关于Rhizoctonia物种复合体在三种陆地兰花中系统性定殖的研究。数据记录了兰花与真菌的互作关系,为植物微生物互作研究提供基础数据,共包含2个文件。 文件详解 OTU表文件 文件名称:OTU_98_n10_verticale.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 禽类血吸虫寄生虫丰度与宿主占有率的关系数据

    2026年2月1日 30 13 4

    数据集概述 本数据集用于验证寄生虫丰度-占有率关系(AOR)的生态位宽度假说和权衡假说。包含386个血孢子虫细胞色素b谱系(1894条序列)及2318只鸟类(103种)的样本信息,覆盖西北非、西北伊比利亚、大高加索西部和外高加索地区。数据支持分析谱系分布区域数与频率的关联,以及宿主泛化/特化对丰度的影响,共含2个文件。 文件详解...
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  • 血红菌科_哥伦比亚野生鸟类血液细菌的基因序列数据

    2026年2月1日 30 171 164

    数据集概述 本数据集记录哥伦比亚Jardín市野生鸟类血液中细菌的基因序列研究结果,通过16S qPCR和测序技术,从雀形目及类雀形目鸟类血液样本中检测出细菌16S基因,涉及7种鸟类、4类血细菌,包含基因序列文本与样本数据表格两类文件。 文件详解 SEQUENCES BACTERIA BIRDS.txt 文件格式:TXT...
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  • 文昌鱼的吞噬性细胞内消化机制_消化与免疫研究数据

    2026年2月1日 30 75 55

    数据集概述 本数据集为文昌鱼(Branchiostoma)吞噬细胞内消化研究相关数据,包含8个文件,涵盖基因表达谱、统计数据、序列信息等内容,支持研究文昌鱼消化道上皮细胞的消化功能与免疫基因表达特征,以及不同生理状态下的细胞功能变化。 文件详解 文件列表及格式 表格文件(.xlsx,共6个):包含统计数据与信息汇总,如Table S3_The...
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  • TLR_Based_伯氏鹨种群免疫基因变异研究数据

    2026年1月31日 30 5 0

    数据集概述 本数据集聚焦伯氏鹨(Anthus berthelotii)13个岛屿种群及近缘种草原鹨(Anthus campestris)的 toll-like...
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  • Arena_Based_RNA结构重建基准测试数据集

    2026年1月31日 30 46 1

    数据集概述 本数据集包含Arena程序相关的基准测试数据,用于评估RNA结构重建程序的性能。数据集分为五个压缩文件,涵盖Arena源代码、基准测试用数据集、RNA核苷酸序列、PDB ID列表及RNA分类文件,为RNA结构重建研究提供标准化测试资源。 文件详解 Arena-main.zip 文件格式:ZIP...
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  • 沃尔巴克氏菌线粒体DNA变异体与宿主种群入侵监测数据

    2026年1月31日 30 36 2

    数据集概述 本数据集包含Wolbachia入侵宿主种群动态监测相关的线粒体DNA(mtDNA)变异数据,涵盖蚊虫样本的核苷酸序列、样本详情、RADseq位点信息及分析脚本等,用于研究Wolbachia释放后在宿主种群中的传播规律及相关影响因素,共包含9个文件。 文件详解 核苷酸序列文件(共6个) 文件名称:Nucleotide...
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  • Timema_project_孤雌生殖进化分析中间数据

    2026年1月31日 30 127 16

    数据集概述 本数据集包含Timema竹节虫孤雌生殖进化分析过程中产生的关键中间文件,涵盖基因序列、进化树、直系同源群压缩包及格式化文本等类型,共七个文件,用于支持昆虫孤雌生殖进化机制的研究。 文件详解 基因序列文件(.fasta格式) 文件名称:trimmed_onesp_COIseqs_def.fasta、all_COIseqs.fasta...
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  • Rhinella_蟾蜍群_系统发育关系_分子生物学研究数据

    2026年1月29日 30 89 71

    数据集概述 本数据集聚焦南美及巴拿马分布的Rhinella granulosa蟾蜍群(共13种)的系统发育关系研究,采用5个核基因与4个线粒体基因(单样本最长7910bp)进行分析,揭示了该类群的单系性、核与线粒体序列的拓扑不一致性及杂交渐渗事件,是两栖动物分类学与进化研究的重要分子数据支撑。 文件详解 文件名称:alignments.zip...
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  • Z_DNA_Z_RNA_Based人类疾病关联研究核心数据

    2026年1月29日 30 85 79

    数据集概述 本数据集围绕Z-DNA/Z-RNA与人类疾病的关联展开,涉及Zα结构域蛋白家族(如ADAR、ZBP1)对左 handed Z-DNA/Z-RNA的高亲和力结合机制,以及ADAR、DICER1功能缺失与Aicardi-...
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  • MARV_Genomic_Based密码子使用进化分析数据

    2026年1月29日 30 32 0

    数据集概述 本数据集为马尔堡病毒(MARV)基因组密码子使用模式的分析数据,包含病毒全核苷酸序列及密码子分析结果。通过多种分析方法探究突变压力、自然选择及宿主(人类、埃及果蝠)对MARV密码子使用的影响,揭示其进化机制,共包含2个文件。 文件详解 文件名称:marburg.full.nucleotide.txt 文件格式:TXT...
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  • Dryad_JEB2012_月见草防御基因适应性进化研究数据

    2026年1月29日 30 24 7

    数据集概述 本数据集围绕月见草(Onagraceae)防御基因的适应性分子进化展开,对比有性繁殖与功能性无性繁殖谱系的基因进化差异,包含两类文件,总计两个文件。 文件详解 文件名称:Dryad_JEB2012_ChiB.docx 文件格式:DOCX...
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  • CrERVγ_Based骡鹿内源性逆转录病毒种群历史研究数据

    2026年1月29日 30 127 50

    数据集概述 本数据集围绕骡鹿(Odocoileus hemionus)内源性逆转录病毒(CrERVγ)的种群历史展开,包含13个前病毒在15个种群262只骡鹿中的分布数据、骡鹿种群位置信息、白尾鹿CrERV-in14序列及微卫星数据,用于分析宿主-病毒共进化及宿主种群进化历史。 文件详解 Mule Deer_ERVData_Locations.xlsx...
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