数据集概述
本数据集围绕19株菠菜霜霉病菌（Peronospora effusa）分离株展开比较研究，包含各分离株的基因组组装、基因注释、重复序列注释及分相变异数据，用于构建泛基因组图谱及9号染色体分相图谱，支持抗性突破进化机制分析。
文件详解
- 基因组组装文件：
- genome_assembly.zip（ZIP格式）：包含19株分离株的基因组组装数据
- 基因与重复序列注释文件：
- gene_annotation.zip（ZIP格式）：基因注释数据
- repeat_annotation.zip（ZIP格式）：重复序列注释数据
- 分相变异数据：
- phased_variants.zip（ZIP格式）：全基因组分相变异数据
- Chr9_phased.zip（ZIP格式）：9号染色体分相变异数据
- 泛基因组图谱文件：
- Pe.full.gfa.gz（GZ压缩格式）：全基因组泛基因组图谱（GFA格式）
- Pe_Chr9_phased.full.gfa.gz（GZ压缩格式）：9号染色体分相泛基因组图谱（GFA格式）
- Pe_minigraph.gfa（GFA格式）：简化版泛基因组图谱
适用场景
- 植物病理学研究：分析菠菜霜霉病菌抗性突破的分子进化机制
- 基因组学分析：开展病原菌泛基因组结构与变异特征研究
- 抗病育种应用：挖掘与抗性相关的关键基因位点
- 分子生物学研究：解析病原菌基因注释及重复序列功能
- 进化生物学研究：探索病原菌种群遗传多样性与适应性进化规律
