数据集概述
本数据集包含从人类分离的3株Aliarcobacter butzleri菌株（LMG 10828T、LMG 11119、31）的基因组组装序列、Prokka功能注释文件及logFC表，共计25个文件，覆盖基因组序列、功能注释、差异表达分析等多类数据。
文件详解
- 基因组序列文件
- 示例文件：31.fna、LMG10828T.fna、LMG11119.fna等
- 格式：.fna、.fasta
- 内容：各菌株的基因组组装序列
- 功能注释文件
- 示例文件：LMG10828T.tbl、31.gbf、LMG11119.gff等
- 格式：.tbl、.gbf、.gff、.ffn、.faa、.sqn
- 内容：Prokka生成的功能注释信息，包括基因特征表、序列文件、蛋白质序列等
- 转录组差异表达文件
- 文件名称：DEGs.xlsx
- 格式：.xlsx
- 内容：3株菌株的logFC差异表达基因表
适用场景
- 微生物基因组学研究: 分析Aliarcobacter butzleri的基因组结构与基因组成
- 功能基因注释分析: 利用Prokka注释文件研究菌株的基因功能与代谢通路
- 转录组差异表达分析: 通过logFC表探究不同菌株间的基因表达差异
- 病原菌分子机制研究: 从人类分离菌株的基因数据中挖掘致病相关基因与机制
