找到70个数据集

标签: fasta

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  • 布氏阿里阿克菌基因注释及转录组数据

    2026年2月15日 30 12 9

    数据集概述 本数据集包含从人类分离的3株Aliarcobacter butzleri菌株(LMG 10828T、LMG 11119、31)的基因组组装序列、Prokka功能注释文件及logFC表,共计25个文件,覆盖基因组序列、功能注释、差异表达分析等多类数据。 文件详解 基因组序列文件...
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  • Local_adaptation_Based_数据集脚本与序列数据

    2026年2月6日 0 166 161

    数据集概述 本数据集包含与本地适应性相关的数据集、脚本及序列文件,共九个文件。主要涵盖汉密尔顿氏菌(Hamiltonella)的多个基因序列、蚜虫(Aphid)及寄生蜂(Parasitoid)的COI序列,以及数据集和脚本文件,可用于生物信息学领域的本地适应性研究。 文件详解 序列文件(.fas/.fa/.fasta格式)...
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  • xlsx2fasta_Based_数据集与处理结果数据

    2026年1月30日 30 38 34

    数据集概述 本数据集包含xlsx2fasta工具相关的数据集与处理结果,共2个文件,无目录结构。文件类型涵盖压缩包和表格文件,主要用于记录xlsx2fasta工具的数据输入与输出结果,支持文件格式转换相关的数据处理场景。 文件详解 数据文件 文件名称:ig_sequences.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • iwc_Based_VGP6b单倍型重叠群去重工作流测试数据集

    2026年1月28日 30 94 64

    数据集概述 本数据集用于iwc工作流测试,核心内容为VGP6b单倍型重叠群的去重相关数据,包含6个文件,覆盖.fasta、.tabular、.gz等5种格式,主要涉及单倍型序列、基因组模型参数、测序读段、数据库文件等,无目录结构,无训练/测试、数据/标签等拆分。 文件详解 序列文件 文件名称:hap1.fasta、hap2.fasta...
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  • NETTAG_葡萄牙莱肖埃斯港_塑料渔网微生物群落原位实验数据

    2026年1月28日 30 6 2

    数据集概述 本数据集来自NETTAG+项目在葡萄牙莱肖埃斯港休闲码头开展的为期一年的原位实验,包含三种塑料渔网(编织聚乙烯、编织尼龙、薄尼龙)表面附着的微生物群落及分离菌株数据,支持相关科学论文研究,共56个文件。 文件详解 原始16S扩增子测序数据...
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  • Local_adaptation_Based_数据集脚本与序列数据

    2026年1月27日 0 96 82

    数据集概述 本数据集包含与本地适应性相关的数据集、脚本及序列文件,共九个文件。主要涵盖汉密尔顿氏菌(Hamiltonella)的多个基因序列、蚜虫(Aphid)及寄生蜂(Parasitoid)的COI序列,以及数据集和脚本文件,可用于生物信息学领域的本地适应性研究。 文件详解 序列文件(.fas/.fa/.fasta格式)...
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  • Dryad_BaSk_clade_自由生活后鞭毛虫线粒体减少研究数据

    2026年1月25日 30 120 75

    数据集概述 本数据集包含五个新发现的自由生活后鞭毛虫(BaSk进化枝)的高质量基因组草图、转录组和预测蛋白质组数据。通过系统基因组学分析揭示其线粒体相关细胞器(MROs)蛋白组极度简化,部分物种甚至丢失线粒体功能,为研究自由生活生物线粒体丢失机制提供关键资源。 文件详解 文件名称:dryad.zip 文件格式:ZIP...
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  • yevis_getting_started线粒体测序分析工作流完整数据

    2026年1月26日 30 145 78

    数据集概述 本数据集是manabuishii/yevis-getting-started项目中的一个工作流数据,包含31个文件,涉及人类线粒体基因组分析所需的参考序列、配置文件、工作流脚本等。数据覆盖参考基因组文件、索引文件、黑名单位点文件、工作流定义文件(WDL)、输入参数配置文件等类型,用于支持线粒体基因组的比对、变异检测等分析流程。 文件详解...
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  • PDE6_Genes_Based_脊椎动物磷酸二酯酶6基因进化与表达研究数据

    2026年1月20日 30 190 4

    数据集概述 本数据集围绕磷酸二酯酶6(PDE6)基因展开,包含其在脊椎动物中的进化分析、比较同线性分析及斑马鱼中的基因表达数据,涉及催化亚基与抑制亚基基因家族的扩张、新成员鉴定及昼夜表达振荡特征等内容,共21个相关文件。 文件详解 系统发育分析文件(.phb格式) 示例文件:PDE6_catalytic-...
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  • CHIKV_Based_巴西塞阿拉州基孔肯雅病毒感染致死病例研究数据

    2026年1月26日 30 176 29

    数据集概述 本数据集为巴西东北部塞阿拉州基孔肯雅病毒(CHIKV)感染致死病例的研究数据,包含100例疑似虫媒病毒感染致死病例的检测结果,涉及临床、流行病学特征及病毒基因组分析,共9个相关文件。 文件详解 系统发育分析文件...
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  • Vitellogenin_like_A_蚂蚁社会分工行为调控实验数据

    2026年1月25日 30 92 68

    数据集概述 本数据集围绕蚂蚁Temnothorax longispinosus的Vitellogenin-like A(Vg-like A)基因展开,包含基因序列比对、基因敲降实验原始数据、行为测试结果、化学分析及基因表达数据等11个文件,用于探究Vg-like A通过调控社会线索响应性影响蚂蚁行为任务分工的机制,支持昆虫社会分工分子调控机制的研究。...
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  • Habronattus_Salticidae_Based跳蛛物种复合体渐渗杂交进化影响研究数据

    2026年1月11日 30 127 12

    数据集概述 本数据集聚焦跳蛛Habronattus americanus物种复合体,探究渐渗杂交对其进化的影响。通过RADseq、超保守元件(UCEs)及形态学数据,分析基因组与形态的进化模式,揭示快速辐射与频繁渐渗导致的网状进化历史,包含267个文件,以基因序列数据为主。 文件详解 基因序列文件...
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  • MHC_Grouse_Based松鸡MHC基因选择与基因转换进化研究数据

    2026年1月22日 30 10 7

    数据集概述 本数据集聚焦松鸡MHC基因进化研究,包含松鸡MHC基因的序列数据和基因型数据,用于分析MHC I类和II类基因在选择压力与基因转换作用下的不同进化历史,揭示松鸡免疫系统应对胞内、胞外病原体的分子进化机制差异。 文件详解 序列文件(.fasta格式) Grouse MHC class II BLB sequences (BLB1...
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  • PlantHost_SoilOrigin_木本植物根系微生物群落实验数据

    2026年1月22日 30 80 62

    数据集概述 本数据集记录了“植物宿主与土壤来源对木本植物根系真菌和细菌群落的影响”实验的相关数据,包含实验设计、样本测序结果及数据分析文件,涉及Populus、Quercus、Pinus三种木本植物,通过454扩增子测序分析16S、SSU、ITS、LSU rDNA四个基因位点的微生物群落,共10个文件。 文件详解 测序数据文件(.gz格式)...
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  • MEC_Letsch_Based蜻蜓系统发育与栖息地分化研究数据2016

    2026年1月21日 30 83 80

    数据集概述 本数据集围绕蜻蜓(Anisoptera: Odonata: Insecta)的系统发育与栖息地分化展开,基于8个核基因和线粒体基因,通过模型进化框架分析栖息地使用对分化模式的影响。数据包含序列比对文件及分区方案,用于研究蜻蜓从流水(lotic)到静水(lentic)栖息地的独立殖民化过程,以及栖息地对物种形成速率的影响。 文件详解...
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  • Hippeastreae_Based_植物二倍体系统发育与杂交事件研究数据

    2026年1月21日 30 7 1

    数据集概述 本数据集为石蒜科Hippeastreae族二倍体类群的系统发育研究数据,包含通过杂交富集和下一代测序获得的18个核基因座、近完整质体基因组及39个自动组装基因座数据,用于分析该类群的进化关系、基因树异质性及核质不一致性,探究古老杂交事件和不完全谱系分选的影响。 文件详解 代码文件...
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  • Host_derived_viral_海洋浮游植物病毒氮吸收转运蛋白研究数据

    2026年1月20日 30 6 1

    数据集概述 本数据集为论文“Host-derived viral transporter protein for nitrogen uptake in infected marine...
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  • Ochotona_sikimaria_Based喜马拉雅鼠兔隐存谱系研究数据

    2026年1月20日 30 181 174

    数据集概述 本数据集包含喜马拉雅鼠兔隐存谱系研究的相关数据,涉及遗传学、形态学和生态学分析。通过对锡金喜马拉雅地区鼠兔样本的采样、测量及基因数据分析,揭示了隐存谱系Ochotona sikimaria的存在,支持其从亚种提升至物种水平,数据涵盖基因序列、进化树、分歧时间表等,共10个文件。 文件详解 基因序列文件(.fasta格式)...
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  • Vulpes_vulpes_Based_赤狐全分布区多基因谱系地理学研究数据

    2026年1月20日 30 161 31

    数据集概述 本数据集是赤狐(Vulpes vulpes)全分布区多基因谱系地理学研究的相关数据,包含线粒体DNA、核基因、Y染色体等多类型遗传数据及分析文件,用于探究赤狐的起源、种群分化、洲际基因交流及种群历史动态,支持赤狐物种形成机制的研究。 文件详解 系统发育树文件(.tree格式,共3个)...
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  • Atriophallophorus_Based_新西兰寄生虫分子数据与分析规范

    2026年1月19日 30 28 6

    数据集概述 本数据集为新西兰Atriophallophorus属吸虫寄生虫研究的配套数据,包含SNP数据、样本信息、系统发育分析结果、序列比对文件及分析输入文件,支持研究该属寄生虫的系统发育地理格局与隐存种结构,共含17个文件。 文件详解 数据文件(.fasta格式,共8个)...
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