数据集概述
本数据集包含两种线虫（C. elegans JU1580和C. briggsae JU1264）的RNA测序数据，通过Roche Titanium基因组测序仪获得。数据经质量和重复序列过滤后，从中发现了两种新的诺达病毒科成员，分别为Orsay诺达病毒和Santeuil诺达病毒，对应测序读段数量分别为1046条和2492条。
文件详解
- 文件名称：Celegans-Nodavirus.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含FASTA格式的RNA测序原始数据，涵盖C. elegans JU1580和C. briggsae JU1264两种线虫的测序读段，其中包含Orsay诺达病毒和Santeuil诺达病毒的相关序列信息。
数据来源
论文“Natural and experimental infection of Caenorhabditis nematodes by novel viruses related to nodaviruses”（PubMed ID: 21283608）
适用场景
- 病毒发现研究：通过线虫RNA测序数据挖掘新的病毒成员，尤其是诺达病毒科相关病毒。
- 线虫病毒感染机制分析：探究线虫自然感染病毒的分子基础及病毒与宿主的相互作用。
- 分子病毒学研究：基于FASTA格式的测序读段进行病毒基因组组装、进化分析及功能预测。
- 比较病毒学分析：对比不同线虫物种中病毒的分布差异及宿主特异性。
