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生态连通性_南极湖泊RNA病毒_准种群结构数据
2026年2月1日 30 64 35
数据集概述 本数据集围绕南极利文斯顿岛Limnopolar湖RNA病毒准种结构展开，包含5个相关文件。研究首次通过宏基因组学方法分析该湖泊RNA病毒准种特征，探讨生态连通性对病毒准种复杂性的调控作用，涉及RNA病毒基因型混合体、准种结构动态及宿主感染等内容。 文件详解 RdRp_Alignment.fa 文件格式：FA...
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C_elegans_RNA_线虫病毒发现测序原始数据
2026年1月31日 30 182 72
数据集概述 本数据集包含两种线虫（C. elegans JU1580和C. briggsae JU1264）的RNA测序数据，通过Roche Titanium基因组测序仪获得。数据经质量和重复序列过滤后，从中发现了两种新的诺达病毒科成员，分别为Orsay诺达病毒和Santeuil诺达病毒，对应测序读段数量分别为1046条和2492条。 文件详解...
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MARV_Genomic_Based密码子使用进化分析数据
2026年1月29日 30 93 23
数据集概述 本数据集为马尔堡病毒（MARV）基因组密码子使用模式的分析数据，包含病毒全核苷酸序列及密码子分析结果。通过多种分析方法探究突变压力、自然选择及宿主（人类、埃及果蝠）对MARV密码子使用的影响，揭示其进化机制，共包含2个文件。 文件详解 文件名称：marburg.full.nucleotide.txt 文件格式：TXT...
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reassortment_Based_流感病毒重配路径研究数据
2026年1月28日 30 157 64
数据集概述 本数据集围绕流感病毒重配路径研究展开，包含支持重配事件检测算法开发的相关文件。研究提出两种检测方法（MLreassort和Breassort），可识别流感等分段病毒的重配事件，数据集含2个压缩文件，用于算法实现与验证。 文件详解 文件名称：scripts_reassort.zip 文件格式：ZIP...
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Anellovirus_33种圆环病毒FASTQ数据集2023
2026年1月28日 30 79 49
数据集概述 本数据集包含三十三种圆环病毒的FASTQ数据，由十六组计算机模拟生成，核苷酸序列与2023年第一版灵长类圆环病毒数据库序列的一致性从百分之百到百分之八十五不等。数据通过art_illumina软件生成，可用于病毒基因组相关分析。 文件详解 文件名称：dataset-33Anelloviruses-2023.zip 文件格式：ZIP...
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FMDV_Based_O型口蹄疫病毒持续感染牛基因组突变研究数据
2026年1月28日 30 59 3
数据集概述 本数据集为Litz等人研究的附加数据，聚焦O型口蹄疫病毒（FMDV）在牛持续感染过程中的基因组突变。包含7个文件，涵盖序列比对、元数据、进化树等类型，记录病毒基因组变异、样本信息及实验关联数据，支持病毒基因组进化与持续感染机制研究。 文件详解 CSV文件（共2个） 文件名称：NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-...
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Microviridae_2012_病毒科基因组进化多样性研究数据
2026年1月27日 30 7 3
数据集概述 本数据集包含81个新组装的Microviridae病毒科完整基因组序列及相关注释文件，源自不同生态系统的病毒宏基因组。数据支持对该病毒科的进化多样性分析，包括新亚科Pichovirinae的发现、基因组结构特征及水平基因转移现象研究，为理解其生态作用和起源提供基础。 文件详解 说明文档：...
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NCBI_SRA_Based_地中海海域宏基因组组装基因组与病毒基因组数据_2019_2022
2026年1月12日 30 133 90
数据集概述 本数据集包含地中海西部近海单站位采集的四个海洋样本的宏基因组组装基因组（MAGs）和宏基因组组装病毒基因组（MAVGs）。样本覆盖夏季分层水体的不同深度（上层透光层、深层叶绿素最大值层、下层透光层）及冬季混合期，采用Illumina NextSeq短读长和PacBio Sequel II长读长技术测序，共包含3个文件。 文件详解...
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Supp_Info_Based_穿山甲冠状病毒宏基因组污染分析补充数据
2026年1月22日 30 27 15
数据集概述 本数据集为穿山甲冠状病毒宏基因组污染分析的补充信息，包含3个文件，涉及GD、GX穿山甲冠状病毒相关宏基因组数据集（PRJNA641544、PRJNA606875、PRJNA573298）的分析结果，用于支撑"污染广泛存在削弱穿山甲宿主归因"的研究结论，为病毒基因组研究提供补充数据。 文件详解...
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佐藤秀树_Sathuperi_Shamonda_在日本分离的病毒基因组序列数据
2026年1月20日 30 160 61
数据集概述 本数据集为论文“日本分离Sathuperi和Shamonda病毒的全基因组序列”的补充信息，包含1个文件，记录与该研究相关的引物列表数据，用于支持病毒基因组序列的研究分析。 文件详解 文件名称：primer list.xlsx 文件格式：XLSX...
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SARS_CoV_2_Early_Pandemic_儿童早期感染病毒分子多样性研究数据
2026年1月14日 30 72 25
数据集概述 本数据集包含169条SARS-CoV-2基因组序列及补充表格，用于研究早期疫情期间儿童感染该病毒的分子多样性特征。数据集共2个文件，涵盖病毒基因组序列与研究相关的补充信息，为儿童群体SARS-CoV-2分子演化研究提供基础数据。 文件详解...
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Viral_Dark_Matter_Based_微生物基因组病毒暗物质与宿主相互作用数据
2026年1月13日 30 112 23
数据集概述 本数据集通过挖掘公共细菌和古菌基因组数据，识别出12,498个高置信度病毒基因组及其关联的微生物宿主。数据补充了现有公共数据集，提供13个新细菌门的首条病毒序列，助力解析病毒组中未知序列空间，包含病毒分类、基因组重组、原噬菌体及共感染等分析内容。 文件详解 文件名称：VirSorter_Curated_Dataset_genbank-...
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Expanding_chicken_gut_virome_鸡肠道病毒多样性与宿主互作研究补充数据
2026年1月8日 30 35 27
数据集概述 本数据集是“Expanding the chicken gut virome: Uncovering viral diversity, host interactions, and regional variations across the intestinal...
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Multipartite_Virus_Based_多分体病毒进化建模_基因组公式适应异质环境数据_2020
2025年12月30日 30 3 1
数据集概述 本数据集围绕多分体病毒进化建模展开，聚焦基因组公式如何助力病毒快速适应异质环境。研究探讨了多分体病毒基因组片段频率（即设定点基因组公式SGF）与细胞感染复数（MOI）的关系、SGF的快速收敛特性，以及多分体病毒与单分体病毒的竞争优势条件，为理解病毒适应性机制提供支持。 文件详解...
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西尼罗河病毒感染动物病毒基因组拷贝数数据表2018
2025年12月19日 30 138 5
数据集概述 该数据集呈现2018年以色列西尼罗河病毒（WNF）阳性马属动物的病毒基因组拷贝数检测结果，包含动物编号、物种、采样时间、地点、组织检测数据及备注信息，为病毒感染病理研究提供量化依据。 文件详解 文件名称：table.html 文件格式：HTML 核心字段： Animal no.：动物编号 Species：物种（马、驴） Date：采样日期...
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西尼罗河病毒在禽类中的病理发现与病毒基因组拷贝数数据集2018
2025年12月16日 30 89 8
数据集概述 本数据集呈现了2018年以色列禽类和马类西尼罗河病毒（WNV）分子特征研究中的表2数据，核心内容为WNV阳性禽类的病理发现及病毒基因组拷贝数检测结果，涉及不同鸟类物种的组织样本检测数据。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML 字段映射:...
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Virosaurus病毒基因组参考序列数据集
2025年12月15日 30 138 69
数据集概述 该数据集是一个经过整理的病毒基因组参考数据库，旨在为临床宏基因组学分析提供支持。包含脊椎动物病毒、其他病毒（昆虫、真菌、真核微生物）和植物病毒的聚类、注释序列及完整基因组/片段序列，以FASTA格式存储，部分文件经压缩处理。 文件详解 该数据集包含八个文件，具体说明如下： - 压缩格式序列文件（.gz）：共七个，按病毒类型和聚类阈值分类 -...
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混合病毒感染对多分体黄瓜花叶病毒基因组公式影响数据集
2025年12月11日 30 209 141
数据集概述 本数据集围绕混合病毒感染对多分体黄瓜花叶病毒（CMV）基因组公式的影响展开，包含qPCR测定的基因组公式、病毒滴度等实验数据，以及用于模拟感染机制的模型代码和分析文件，为研究病毒基因组变化提供支持。 文件详解 数据文件（.csv格式）：...
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Viridian共识序列与元数据2024_10_14
2025年12月9日 30 160 116
数据集概述 该数据集是对Viridian SARS-CoV-2数据集的重新打包，包含2024年10月14日批次1和批次2的共识序列与元数据。通过MAFFT对齐至武汉参考序列，并转换为VCF Zarr格式，以单个压缩包提供紧凑易访问的数据。 文件详解 文件名称：viridian_mafft_2024-10-14_v1.vcz.zip...
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德国SARS_CoV_2病毒基因组序列数据集
2025年12月5日 30 77 28
数据集概述 本数据集包含德国境内SARS-CoV-2病毒的基因组序列及相关元数据，旨在支持病毒传播路径追踪、变异监测及耐药性预测等研究。数据覆盖2023年5月31日前通过DESH提交至RKI的序列，以及后续IMSSC2实验室网络和Charité冠状病毒参考中心提供的样本，确保对病毒种群的代表性观察。 文件详解 序列数据文件： SARS-...
