数据集概述
本数据集包含334个弯曲杆菌毒力相关基因的核苷酸与蛋白质数据库,共3个文件。核心内容为毒力相关基因的详细信息,包括基因来源菌株、基因座标签、基因及蛋白质长度、毒力因子类别分类,以及相位变异基因标识和其功能性蛋白质序列,支持通过BLAST工具进行基因搜索与功能分析。
文件详解
- database_information.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含334个弯曲杆菌毒力相关基因的详细信息,具体字段有基因来源菌株、对应基因座标签、基因长度、蛋白质长度、毒力因子类别分类,以及相位变异基因的标识(标注存在相位变异的基因)。
- Campylobacter_virulence_genes_db_PROT.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:弯曲杆菌毒力相关基因的蛋白质序列数据库,包含存在相位变异基因的功能性(ON)蛋白质序列。
- Campylobacter_virulence_genes_db_NUCL.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:弯曲杆菌毒力相关基因的核苷酸序列数据库。
适用场景
- 弯曲杆菌毒力机制研究:分析毒力相关基因的序列特征、分类及相位变异对功能的影响。
- 病原菌分子诊断:通过BLASTn/tBLASTn工具搜索核苷酸/蛋白质数据库,识别潜在毒力基因。
- 相位变异基因功能分析:针对标注的相位变异基因,研究其功能性(ON)蛋白质的作用机制。
- 生物信息学数据库应用:为弯曲杆菌相关的基因功能注释、进化分析提供基础数据支持。