数据集概述
本数据集为苔草属Heleoglochin组分类研究的支撑数据,包含60份代表性标本的核核糖体DNA间隔区序列数据、303份标本的17个营养与花序形态特征数据、56份标本的23个雌器苞形态特征数据,以及系统发育分析结果文件,共十六份文件,用于澄清该组的分类界限与系统发育关系。
文件详解
- 说明文件(README类)
- 文件名称:如README_for_ITS.ETS.2014.08.21.txt、README_for_Micromorphological data.txt等
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:共十二个说明文件,分别对应分子序列、微形态数据、系统发育分析结果等子数据集的描述,含数据背景、生成方法及使用说明
- 分子序列数据文件
- 文件名称:如ITS.ETS.2014.08.21.txt、all.ITS.2014.08.21.txt、all.ETS.2014.08.21.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含核核糖体DNA内转录间隔区(ITS)和外转录间隔区(ETS)的序列数据,对应研究中60份代表性标本的分子标记信息
- 微形态数据文件
- 文件名称:Micromorphological data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:含23个雌器苞微形态特征字段(如scariouspist_scale、shinyperigynia、perigyniumshape等),对应56份标本的形态测量数据
- 系统发育分析结果文件
- 文件名称:如RAxML_bipartitions.ITS.ETS.2014.08.21.raxd.tre、RAxML_ETS.2014.08.21.raxd.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:最大似然法(RAxML)构建的系统发育树文件,记录Heleoglochin组物种的亲缘关系与分支支持率
- 系统发育分析参数文件
- 文件名称:ITS.ETS.2014.08.21.longRun.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:系统发育分析的参数配置元数据文件,记录分析的算法设置与运行参数
数据来源
论文“Molecular and morphological perspectives on the circumscription of Carex section Heleoglochin (Cyperaceae)”
适用场景
- 植物系统分类研究:用于分析苔草属Heleoglochin组的分类界限,验证传统分类系统的合理性
- 分子系统发育分析:基于ITS、ETS序列数据探究该组物种的亲缘关系与演化历史
- 植物形态特征演化研究:结合分子与形态数据,分析苔草属植物形态特征的演化规律
- 生物地理学研究:通过系统发育结果与地理分布数据,探讨该组物种的地理分化模式
- 植物分类学方法验证:用于评估整合分子与形态数据的分类学研究方法的有效性