数据集 - 海数据

Molecular_Pleuronectiformes_单系性分子证据研究数据

2026年1月20日 30 44 13

数据集概述本数据集为支持鲽形目（Pleuronectiformes）单系性的分子证据研究数据，包含基因树、补充表格及组合数据集等文件。针对该类群进化关系的争议，通过重新分析现有数据并结合新数据，明确支持其单系性，反驳了不对称体型独立起源的观点，为解决系统发育难题提供数据支撑。文件详解文件名称：GENE_TREES_STAR_SP_TREE.tre...

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Platania_Cardoso_Based_新喀里多尼亚叶甲生物地理分析数据

2026年1月19日 30 51 17

数据集概述本数据集为Platania, Cardoso et al.关于新喀里多尼亚叶甲生物地理研究的配套数据，包含系统发育树、模型参数文件、序列比对分区信息、多基因序列数据及生物地理分析输入文件压缩包，共5个文件，支撑南太平洋特有叶甲谱系的历史生物地理研究。文件详解系统发育树文件...

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Epinecrophylla_Based_新热带区枯叶觅食蚁鹩系统发育研究数据

2026年1月19日 30 193 96

数据集概述本数据集为新热带区枯叶觅食蚁鹩（Epinecrophylla属）的系统发育研究数据，基于超保守元件（UCEs）大规模平行测序，包含该属8个物种的亚种级系统发育树、种群遗传分析及修订分类相关的原始与处理数据，共8个文件，支持鸟类分类学与生物地理学研究。文件详解核心分析文件文件名称：UCE_gene_trees-RAxML.tre...

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Dryad_Leptonetid蜘蛛系统基因组学与生物地理学研究数据集2021

2026年1月19日 30 109 22

数据集概述本数据集为Leptonetid科蜘蛛的系统基因组学与生物地理学研究数据，包含基于超保守元件（UCEs）构建的“宽松”和“严格”两种数据矩阵，以及系统发育分析、分子定年、生物地理推断等相关结果文件，共11个文件，支持该科蜘蛛的分类修订、演化历史及分布格局研究。文件详解文档类文件文件名称：READMELedfordetal2021.txt...

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Galápagos_Serpentes_Dipsadidae_蛇类辐射演化研究数据

2026年1月18日 30 157 78

数据集概述本数据集围绕加拉帕戈斯蛇类辐射演化研究展开，包含系统发育分析相关的序列比对、字符集定义及时间校准树文件，支持揭示该类群的起源与隐藏多样性，涉及Pseudalsophis属等物种的分类与演化研究，共7个文件。文件详解系统发育分析文件...

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Metatranscriptomics_Based_鸟类血液寄生虫宏转录组研究数据

2026年1月18日 30 175 65

数据集概述本数据集基于北美鸣禽24份血液样本的宏转录组测序，针对低强度、多物种感染的血液寄生虫（血孢子虫）开展研究。通过分离宿主与寄生虫转录本并分配至血孢子虫属，提供33个系统发育多样化的血孢子虫线粒体谱系的1,502个单拷贝直系同源基因座数据，可支持寄生虫进化与感染检测研究。文件详解文档类文件...

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Hemiptera_UCE_Based_半翅目系统发育研究诱饵集与基因组资源整合数据

2026年1月18日 30 190 48

数据集概述本数据集基于为半翅目系统发育设计的超保守元件（UCE）诱饵集，包含36个半翅目样本（覆盖3个亚目、7个异翅亚目下目、23科、34属）及1个缨翅目外群的UCE数据，同时整合了已发表基因组/转录组的UCE位点挖掘结果，可支持系统发育、种群遗传及分子进化研究。文件详解 RAxML_alignInput_&_Trees.zip...

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Metazoa_Phylogenetic_Signal_后生动物系统发育基因组数据集

2026年1月18日 30 3 0

数据集概述本数据集为后生动物系统发育研究的基因组数据，包含1080个直系同源基因座，源自36个公开基因组，覆盖主要动物类群。数据用于优化系统发育信号分区，支持栉水母作为其余后生动物姊妹群的结论，提供基因组系统发育分析的工作流与工具，共15个文件。文件详解 RAxML_single_genes.zip 文件格式：ZIP...

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Illumina_HiSeq_Based_长PCR产物平行扩增子测序与转录组组装数据

2026年1月18日 30 148 74

数据集概述本数据集记录了利用Illumina HiSeq平台对长PCR产物进行平行扩增子测序的方法及结果，包含序列比对文件、共识序列、系统发育树文件及分析脚本，可支持物种系统发育与种群遗传学研究，共6个文件。文件详解序列比对文件文件名称：Alignment_for_RAxML.phy 文件格式：PHY...

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Hawkmoth_Dryad_Based_反蝙蝠超声产生与声纳干扰行为及系统发育数据

2026年1月18日 30 137 47

数据集概述本数据集聚焦天蛾与蝙蝠的协同进化关系，包含124种天蛾对蝙蝠声纳攻击的超声响应行为数据、蝙蝠-天蛾捕食实验结果，以及基于多基因构建的化石校准系统发育树。数据覆盖天蛾超声产生的功能验证（声纳干扰）和进化历史分析，涉及约1500种天蛾的防御策略起源与分化时间研究。文件详解系统发育树文件...

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Tamalia_inquilinus_Based社会性寄生蚜虫起源与遗传分化研究数据

2026年1月18日 30 24 7

数据集概述本数据集包含社会性寄生蚜虫Tamalia inquilinus起源与遗传分化研究的相关文件，涉及基因序列、系统发育树、表达分析结果等内容，支持对该蚜虫与宿主的进化关系、种群结构及宿主植物关联分化的研究，共10个文件。文件详解系统发育树文件（.tre格式，共4个）...

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TEP_Prionurus_Species_Based_热带东太平洋刺尾鱼物种界定研究数据

2026年1月12日 30 188 93

数据集概述本数据集为热带东太平洋（TEP）Prionurus属刺尾鱼的物种界定研究数据，整合了线粒体基因、核基因位点、形态测量、生态位比较等多维度信息，用于分析带斑点与无斑点表型刺尾鱼的进化关系与物种界限，结果支持二者为同一物种。文件详解文件名称：Nobia-maf02_SNPS.vcf，格式：VCF...

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Becchimanzi_2025_榛子内生镰刀菌分离株基因组测序及系统发育代谢组学分析数据

2026年1月17日 30 199 184

数据集概述本数据集包含Becchimanzi等人2025年手稿相关的原始数据和输出文件，核心内容为榛子内生镰刀菌分离株（Fusarium sp. Hzn5）的基因组测序数据，以及antiSMASH分析结果和系统发育重建文件，用于支持系统发育与代谢组学研究。文件详解...

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Japanese_macaque_Phylogeographic_history_data

2026年1月17日 30 26 1

数据集概述本数据集为日本猕猴系统地理学研究数据，包含11个文件，涵盖遗传分析代码、序列数据、种群结构分析结果等。主要用于探究日本猕猴的地理遗传变异模式及进化过程，支持种群结构、基因流、末次盛冰期避难所分布等研究，为理解其系统发育历史提供数据支撑。文件详解代码文件文件名称：calc_pi.R 文件格式：R...

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Haringtonhippus_NewGenus_更新世北美洲马新属基因组与形态测量研究数据

2026年1月17日 30 166 146

数据集概述本数据集包含更新世北美洲NWSL马的线粒体基因组、部分核基因组及形态测量分析数据，支持其单种属分类及新属Haringtonhippus的命名。通过基因组与形态测量结合分析，明确该马类不属于现生马属，为晚更新世灭绝事件研究提供依据，含60个相关分析文件。文件详解系统发育树文件（.tre格式，38个）...

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Syngnatharia_Based鱼类系统基因组学与历史生物地理学研究补充材料

2026年1月15日 30 189 33

数据集概述本数据集是Syngnatharia鱼类（含海马、海龙、鲂鱼等）系统基因组学与历史生物地理学研究的补充材料，包含169种鱼类的基因组数据、时间校准树、祖先分布区估计及敏感性分析结果，覆盖该类群全部10科约25%的物种多样性，用于探究生物地理推断不确定性的驱动因素。文件详解 README.txt 文件格式：TXT...

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phylogenetic_Based_形态学大数据系统发育分析算法性能评估数据集

2026年1月15日 30 78 77

数据集概述本数据集是关于大形态学数据集系统发育分析的概率算法性能评估模拟研究数据。研究测试了MrBayes、RevBayes、IQ-TREE和RAxML四种主流概率软件在不同分类抽样和缺失数据条件下的性能，通过Robinson-Foulds等指标计算推断树与真实树的距离，分析算法准确性、精确性及稳定性。文件详解 R_scripts.zip...

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Cand_Thiosymbion_Based_海洋动物宿主共生菌协同进化研究数据

2026年1月15日 30 77 62

数据集概述本数据集围绕Candidatus Thiosymbion共生菌展开，包含其与线虫（Stilbonematinae）外共生、环节动物（Phallodrilinae）内共生的序列比对、系统发育树等数据，用于研究两类宿主与共生菌的协同进化关系，分析共生生活方式转换及宿主跨界转移的进化事件。文件详解说明文档（.txt）...