数据集概述
本数据集围绕Carpathian蝾螈(Lissotriton montandoni)和smooth蝾螈(L. vulgaris)的分化历史展开,包含基因序列、种群遗传学数据等,用于研究物种间基因交换、种群动态及生殖隔离机制,支持进化生物学领域的分化模型验证与分析。
文件详解
- 压缩文件(.zip格式)
Poly_dataset.zip:多基因数据集压缩包,包含多基因座核序列数据,用于种群遗传学分析
Fasta files.zip:基因序列文件压缩包,存储标准化的基因序列数据
L_montandoni_VCFs.zip:Carpathian蝾螈(Lm)的VCF格式基因变异数据压缩包
L_vulgaris_VCFs.zip:smooth蝾螈(Lv)的VCF格式基因变异数据压缩包
- 序列文件(.fasta格式)
Exons_dataset.fasta:外显子数据集,包含编码区基因序列数据,用于功能基因分析
数据来源
论文“Divergence history of the Carpathian and smooth newts modelled in space and time”
适用场景
- 物种分化模型验证: 利用多基因数据测试Carpathian与smooth蝾螈的分化场景,重建基因流的时空模式
- 种群动态分析: 基于基因变异数据研究物种有效种群大小的历史变化及当前规模
- 生殖隔离机制研究: 分析低迁移率(约10⁻⁶每基因拷贝每世代)与生殖隔离强度的关联性
- 基因流不对称性分析: 探究Carpathian蝾螈与smooth蝾螈进化谱系间基因流的不对称模式及成因
- 进化生物学教学: 作为案例数据用于物种分化、基因流及种群遗传学的教学演示