数据集概述
本数据集聚焦南非开普植物区(CFR)特有植物Restio capensis,通过叶绿体DNA序列和RAD测序获得的14400余个核DNA多态性位点,结合空间、气候及植物地理数据,分析种群分化驱动因素。结果显示环境隔离(IBE)而非地理距离隔离(IBD)是主要驱动因素,为分子生态学研究提供支撑。
文件详解
- 压缩文件1:
FileS1_psref_pschr1-6.Rc.fas.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含Restio capensis 1-6号假参考染色体相关的序列数据文件
- 压缩文件2:
FileS2_psref_pschr9-12.Rc.fas.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:包含Restio capensis 9-12号假参考染色体相关的序列数据文件
- 文本文件:
Table_S5_R.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录南非开普植物区10个Restio capensis种群96个个体的RAD测序数据集信息,包含SNP编号(SNP_NO)、假参考染色体等字段
数据来源
论文“Genomics of the divergence continuum in an African plant biodiversity hotspot, I: drivers of population divergence in Restio capensis (Restionaceae)”
适用场景
- 植物分子生态学研究:分析Restio capensis种群分化的分子机制及驱动因素
- 生物多样性热点区研究:探究南非开普植物区物种形成与维持的基因组学基础
- 环境隔离与地理隔离对比分析:验证IBE和IBD在种群分化中的相对作用
- 植物种群基因组学方法应用:为类似物种辐射研究提供基因组数据分析范例