找到28个数据集

标签: RAD测序

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  • Garvin_Based_潜在适应性线粒体单倍型核基因座识别数据2016

    2026年1月22日 30 194 95

    数据集概述 本数据集为大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)遗传研究数据,基于RAD测序技术,利用潜在适应性线粒体ND5单倍型识别高分化核基因座。包含1个Excel文件,旨在为濒危物种保护管理提供更精准的遗传工具,解决种群间遗传分化弱导致的个体溯源难题。 文件详解 文件名称:Garvin et al. 2016...
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  • PolarBear_SNP_Based北极熊9K_SNP芯片设计原始数据

    2026年1月22日 30 139 121

    数据集概述 本数据集记录了为北极熊(Ursus maritimus)设计的9K Illumina Infinium BeadChip芯片数据,通过RAD测序和转录组测序技术筛选6000个RAD SNPs与3000个转录组SNPs构建芯片,用于研究加拿大北极熊种群精细结构及哈德逊湾西部亚种群表型性状的基因组结构。 文件详解 文件名称:DRYAD.zip...
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  • RAD_Sequencing_Based_中美鲢鳙杂交鉴定SNP标记数据

    2026年1月22日 30 51 23

    数据集概述 本数据集包含通过RAD测序筛选的鲢鱼(Hypophthalmichthys molitrix)和鳙鱼(H. nobilis)物种诊断性SNP标记,用于评估中美两地入侵种群的杂交情况。数据基于中美样本验证,最终确定57个跨区域保守的诊断性SNP位点,可用于识别纯种种群与杂交后代,为入侵物种管理提供遗传工具。 文件详解 文件名称:SNP...
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  • Cyanistes_Based_西古北界蓝山雀进化历史研究_基因组分析数据

    2026年1月21日 0 141 69

    数据集概述 本数据集为西古北界蓝山雀(Cyanistes spp.)进化历史研究的基因组分析数据,包含桑格测序与RAD测序的系统发育树文件、序列矩阵、脚本及说明文档,支持解析其多殖民事件辐射与隔离演化过程,共16个文件。 文件详解 说明文档(.txt)...
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  • Arceuthobium_Based_矮槲寄生种群基因组与宿主动态研究数据

    2026年1月21日 30 176 107

    数据集概述 本数据集为矮槲寄生属(Arceuthobium)种群基因组研究数据,包含通过RAD-sequencing技术获取的SNP数据及相关分析文件,覆盖北美和墨西哥不同宿主上的矮槲寄生样本,用于研究其系统发育分类、宿主特异性及地理因素对遗传结构的影响。 文件详解 文件名称:1_Arceuthobium_sample_info.xlsx...
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  • RAD_Based_深海八放珊瑚Chrysogorgia属物种界定研究数据

    2026年1月21日 30 15 12

    数据集概述 本数据集为RAD测序技术在深海八放珊瑚Chrysogorgia属物种界定中的应用研究数据,包含12个候选物种的系统发育关系分析结果,对比了Stacks和PyRAD两种分析流程,验证线粒体标记的物种界定假设,揭示物种内遗传结构与地理分布的关联,共含2个文件。 文件详解...
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  • PSMC_RAD_Based_PSMC方法RAD测序数据适用性研究_data

    2026年1月20日 30 197 32

    数据集概述 本数据集包含用于PSMC(成对序列马尔可夫合并)方法分析RAD(限制性位点关联DNA)测序数据的代码文件和实证数据。内容涉及PSMC方法在RAD数据中的适用性研究,包括模拟分析和实证案例,旨在为RAD数据的PSMC分析提供指导,共包含4个文件。 文件详解 代码文件(.r格式)...
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  • Pacific_halibut_Source_性别相关基因组区域识别研究数据

    2026年1月20日 0 98 55

    数据集概述 本数据集围绕太平洋大比目鱼性别决定的遗传机制展开,通过RAD测序识别与性别相关的RAD标签,结合其他鱼类基因组比对分析性别决定区域,验证ZW性别决定系统假说,并开发性别鉴定分子标记,为渔业资源管理提供技术支持。 文件详解 文件名称:halibut_genepop.txt 文件格式:TXT...
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  • RAD_Sequencing_Based_大扇贝种群结构与表型可塑性研究数据

    2026年1月20日 30 77 33

    数据集概述 本数据集为RAD测序研究大扇贝种群结构的配套数据,包含大扇贝的微卫星基因型信息。研究通过对比微卫星与RAD测序技术解析种群结构的能力,探究北爱尔兰周边9个大扇贝种群的遗传差异及表型可塑性,数据可支持分子生态学中种群遗传与表型关联的分析。 文件详解 文件名称:Pmaximus_Microsatellite_genotypes.xlsx...
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  • vent_barnacle_深海热液喷口特有藤壶进化历史与生物地理模式研究数据

    2026年1月20日 30 119 4

    数据集概述 本数据集聚焦深海热液喷口特有藤壶的进化历史与生物地理模式,包含基于多基因座和RAD测序的遗传多样性分析数据,用于推断其辐射时间、起源地、扩散模式及多样化过程,为研究深海生物多样性驱动因素提供支撑。 文件详解 文件名称:vent_barnacle_sanger-based_dating.zip 文件格式:ZIP...
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  • RAD_Sequencing_Based_湖白鲑基因流物种形成遗传结构研究数据

    2026年1月19日 30 135 14

    数据集概述 本数据集通过RAD测序分析北美湖白鲑物种对在基因流物种形成过程中的遗传结构,比较五个湖泊中物种对的基因组分化模式,识别抗基因渗入区域并推导屏障强度。数据反映遗传分化受选择位点连锁、生态位分化强度及湖泊特有种群特征影响,为解析物种形成机制提供支撑。 文件详解 5_Lakes_Mapped_2734_FST.txt 文件格式:TXT...
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  • Mugil_cephalus_Based_澳大利亚东部鲻鱼种群遗传SNP标记数据

    2026年1月19日 30 55 44

    数据集概述 本数据集包含澳大利亚东部海域鲻鱼(Mugil cephalus)种群遗传分析的关键数据,涵盖新开发的单核苷酸多态性(SNP)和微卫星标记,以及空间遗传分化的初步估计和后续研究的功率测试结果,为该经济鱼类的可持续管理提供遗传依据。 文件详解 文件名称:Mugil_cephalus_RRL_454.zip 文件格式:ZIP...
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  • Cimex_lectularius_Based臭虫抗药性连锁图谱与QTL分析完整数据

    2026年1月18日 30 1 0

    数据集概述 本数据集为温带臭虫(Cimex lectularius)拟除虫菊酯抗药性的连锁图谱构建与QTL分析相关数据,包含基因分型数据、参考基因组重组、抗药性相关QTL定位等研究内容,涉及334个SNP标记、14个连锁群及抗药性候选基因定位,支持昆虫抗药性遗传机制研究。 文件详解 代码文件(.r、.sh格式)...
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  • Oreochromis_niloticus_Based刚果民主共和国引入种群基因组研究数据集

    2026年1月17日 30 121 28

    数据集概述 本数据集用于研究刚果民主共和国引入的尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)种群基因组特征,包含213份尼罗罗非鱼样本(来自原生及引入区域)和48份其他罗非鱼物种样本的基因分型数据,通过RAD测序获得27611个SNP位点,可分析种群分化、遗传混杂及入侵后果。 文件详解 文件名称:README.docx 文件格式:DOCX...
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  • RAD_Based_Alvord_Basin丘头鱼种群遗传结构与演化历史研究数据

    2026年1月15日 30 136 82

    数据集概述 本数据集为美国俄勒冈州东南部及内华达州北部Alvord Basin区域的Alvord丘头鱼与Borax Lake丘头鱼遗传结构研究数据,通过RAD测序技术获取遗传变异信息,分析种群遗传结构、物种间亲缘关系及演化历史,包含8个相关文件。 文件详解 数据文件 文件名称:Data1_batch_1.catalog.tags.tsv...
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  • 波罗等人基于绿海葵_Anemonia_viridis_共生菌获取遗传数据_补充资料

    2026年1月14日 30 98 71

    数据集概述 本数据集为Porro et al.关于地中海蛇锁海葵(Anemonia viridis)共生菌水平获取机制研究的补充数据,包含宿主动物单核苷酸多态性(SNPs)数据、共生菌ITS2序列数据及共生菌组成表格,用于分析宿主与共生菌群落的关联模式及水平获取能力。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • CFR植物生物多样性热点地区Restio_capensis种群分化基因组学研究数据

    2026年1月14日 30 92 77

    数据集概述 本数据集聚焦南非开普植物区(CFR)特有植物Restio capensis,通过叶绿体DNA序列和RAD测序获得的14400余个核DNA多态性位点,结合空间、气候及植物地理数据,分析种群分化驱动因素。结果显示环境隔离(IBE)而非地理距离隔离(IBD)是主要驱动因素,为分子生态学研究提供支撑。 文件详解...
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  • Anopheles_gambiae_Based_冈比亚按蚊染色体倒位选择靶点机器学习识别研究数据

    2026年1月11日 30 35 23

    数据集概述 本数据集围绕冈比亚按蚊染色体倒位选择靶点识别展开,包含RAD测序数据的分析结果及相关辅助文件。聚焦2La、2Rb等多态性倒位,通过机器学习方法识别选择靶点,对比传统离群值分析,揭示干湿栖息地相关倒位的选择模式,为疟疾媒介快速适应研究提供数据支持。 文件详解 SamplingInfo.csv(CSV格式)...
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  • RAD_sequencing_Zebra_Finch_Genome_留尼汪灰绣眼鸟SNP标记数据

    2026年1月8日 30 33 30

    数据集概述 本数据集通过RAD测序技术结合与斑胸草雀基因组比对,为非模式雀形目鸟类留尼汪灰绣眼鸟生成大量SNP标记。研究使用6个混合样本池测序,构建约60万个contigs,其中38.6万个可比对至斑胸草雀基因组,最终获得8万余个可准确定位且分布均匀的SNP标记,展示了该方法在非模式鸟类中高效开发SNP的潜力。 文件详解...
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  • RAD_SNP_Lontra_canadensis_Based_北美河獭种群监测用SNP阵列开发数据

    2026年1月4日 30 208 99

    数据集概述 本数据集围绕北美河獭(Lontra canadensis)的SNP开发展开,包含通过RAD测序发现的20,772个SNP位点信息,以及经筛选后开发的52个SNP qPCR基因分型检测方案相关内容,可支持河獭种群的遗传监测与个体识别研究。 文件详解 文件名称:StetzEtAl_River_otter SNPs_COGR_si.docx...
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