数据集概述
本数据集是“赤眼蜂预蛹热冷胁迫转录组响应”研究的补充材料,包含赤眼蜂预蛹经10℃、25℃、40℃处理后的转录组测序及差异基因分析相关的表格、图表和验证文件,为探究其温度胁迫分子机制提供支持。
文件详解
- 表格文件(.xls格式):
- Table S3 The co-expressed DEGs in T2 vs T3 and T2 vs T1.xls:包含T2与T3、T2与T1比较组中共同差异表达基因(DEGs)的信息
- Table S2 Annotations of DEGs in T2 vs T3 (heat) and T2 vs T1 (cold).xls:包含热胁迫(T2 vs T3)和冷胁迫(T2 vs T1)差异表达基因的注释信息
- 文档文件(.docx格式):
- Table S1 Primers of differentially expressed genes chosen for qRT-PCR validation.docx:包含用于qRT-PCR验证的差异表达基因引物序列
- 图像文件(.png、.tif格式):
- Figure S3 Histogram of Gene Ontology (GO) classification of DEGs in T2 vs T3 and T2 vs T1.png:差异表达基因的GO分类直方图
- Figure S2 Overlap of differentially expressed genes in the prepupae of T. chilonis under heat and cold treatments.tif:热冷处理下差异表达基因的重叠情况图
- Figure S1 Venn diagrams of unigenes in 3 transcriptome libraries of prepupal T. chilonis.tif:3个转录组文库中unigenes的韦恩图
适用场景
- 昆虫分子生物学研究:分析赤眼蜂预蛹在温度胁迫下的基因表达变化规律
- 差异基因功能研究:基于注释信息探究温度响应相关基因的生物学功能
- 转录组数据分析方法验证:通过qRT-PCR引物文件验证转录组差异基因结果
- 环境胁迫机制研究:揭示昆虫应对极端温度的分子适应机制