找到194个数据集

标签: 转录组

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  • 水稻转录组中病毒多样性的深度分析数据集

    2026年2月9日 30 72 53

    数据集概述 本数据集基于17,115个水稻转录组RNA-seq文库,覆盖24个稻属物种及51个国家样本,通过从头组装和同源性方法鉴定出810个完整或近完整病毒,包括276种已知病毒和534种新型病毒。数据还包含病毒分类注释及与水稻密切相关的427种病毒筛选结果,为水稻病毒病防控提供新见解。 文件详解 压缩文件(Archive files)...
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  • 禁食响应肝基因转录组分析参考基因选择数据

    2026年2月9日 30 169 77

    数据集概述 本数据集为论文“Reference Gene Selection for Expression Analysis of Hepatic Genes Responding to Fasting via Transcriptomic...
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  • Groen_Based_水稻干旱适应进化系统生物学转录组数据

    2026年2月9日 30 141 77

    数据集概述 本数据集为水稻干旱适应进化系统生物学研究的处理后RNA表达计数数据,包含6个水稻品种(涵盖circus-aus、indica和japonica亚种)在湿润与干旱两种田间环境下的转录组数据,通过3'mRNA-seq技术检测叶和冠根的基因表达水平,涉及样本元数据与基因表达计数文件。 文件详解...
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  • Rice_Pi_Stress_磷胁迫时空转录组分析_原始数据

    2026年1月29日 30 30 28

    数据集概述 本数据集为水稻根和地上部响应磷(Pi)饥饿及恢复过程的时空转录组分析数据,基于二代测序技术对9个时间点的126个RNA测序文库进行分析,涵盖磷剥夺早期、晚期及恢复阶段,识别差异表达基因、未注释基因座、可变剪接异构体及miRNA家族,揭示磷稳态调控机制。 文件详解 文件名称:tpc117325SupplementalDS1.xlsx...
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  • DELAY_Based_单细胞轨迹伪时间滞后因果关系分析数据集

    2026年2月9日 30 23 5

    数据集概述 本数据集为DELAY方法配套的单细胞处理数据,用于通过单细胞轨迹的伪时间滞后因果关系分析实现精准的基因调控推断。数据集包含一个压缩文件,无分层目录结构,未划分训练/测试集、数据/标签或原始/处理数据,是单细胞基因调控研究的专用支持数据。 文件详解 文件名称:Datasets.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • SAIGE_QTL_Based_单细胞QTL分析结果数据

    2026年1月30日 30 210 204

    数据集概述 本数据集包含与论文“Efficient statistical method for single-cell QTL analysis”相关的数据对象,涉及SAIGE-QTL方法的应用结果,包括全基因组eQTL定位中p值小于5E-6的遗传变异结果、罕见/低频变异的集合检验结果,以及q值小于0.05的顺式eQTL结果,共5个文件。 文件详解...
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  • 拟南芥生物钟激活因子突变体多组学分析数据集

    2026年2月1日 30 119 116

    数据集概述 本数据集为拟南芥生物钟激活因子RVE4/6/8三突变体的多组学分析数据,涵盖表型组、转录组、蛋白质组和代谢组信息,揭示RVE8类蛋白与碳水化合物代谢、蛋白酶体调控等核心细胞过程的关联,包括突变体的淀粉积累、蛋白酶体活性变化等关键表型相关数据。 文件详解 ReadMe_20220509.docx 文件格式:DOCX...
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  • 拟南芥木质素生物合成扰动响应系统生物学数据

    2026年2月1日 30 25 18

    数据集概述 本数据集通过系统生物学方法研究拟南芥对木质素生物合成扰动的响应,分析了20个木质素生物合成途径单基因突变体的花序茎转录组和代谢组数据,包含566种检测化合物及差异表达基因信息,揭示木质素扰动后的代谢网络变化。 文件详解 文件名称:microarraydata_vanholme_etal_2012_tpc102574.xlsx...
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  • 水稻转录组分析补充数据_盐胁迫响应基因通路数据

    2026年2月1日 30 103 67

    数据集概述 本数据集为论文“Transcriptome Analysis Provides Novel Insights into Salinity Stress Response in two Egyptian Rice Varieties with Different Tolerance...
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  • Dunaliella_salina_多组学响应数据

    2026年1月31日 30 115 21

    数据集概述 本数据集记录盐生微藻杜氏盐藻(Dunaliella salina)在渗透压胁迫下的表观基因组、转录组及表型响应数据,包含2个菌株的群体动态、基因注释及实验说明文件,支持研究不同生物水平可塑性机制及基因型对环境响应的影响。 文件详解 文件名称:README_file.docx 文件格式:DOCX...
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  • 熊猫转录组衍生的巨型熊猫四核苷酸微卫星及其相关基因

    2026年1月31日 30 162 160

    数据集概述 本数据集包含从大熊猫血液转录组中鉴定的20个四核苷酸微卫星位点及其关联基因信息,其中16个位点位于非翻译区(UTRs)、4个位于编码区(CDSs),并提供16个UTR衍生微卫星的基因型数据,为大熊猫遗传与生物医学研究补充基因资源。 文件详解 文件名称:Genotype data of 16 UTR-derived SSRs.xlsx...
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  • 单细胞藻类宿主与其共生海洋硅藻之间的功能关系研究数据

    2026年1月31日 30 162 120

    数据集概述 本数据集围绕甲藻宿主与硅藻内共生体的功能关系展开,包含两种甲藻(Durinskia baltica、Glenodinium foliaceum)宿主与内共生体转录组深度测序相关的分析文件,涉及系统发育分析、肽段聚类等内容,可用于研究两者核质区室的功能整合机制。 文件详解 压缩文件(Archive files)...
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  • 马铃薯与根证书病害相互作用的补充转录组学变化_补充数据

    2026年1月31日 30 49 43

    数据集概述 本数据集为论文“Transcriptional changes in potato sprouts upon interaction with Rhizoctonia solani indicate pathogen induced interference in the defence pathways of...
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  • NEMBASE4_Based线虫转录组资源功能注释数据

    2026年1月30日 30 133 77

    数据集概述 本数据集为线虫转录组资源NEMBASE4的补充数据,包含六十余种线虫(含寄生与自由生活类群)的EST组装转录本、蛋白序列及功能注释信息,支持线虫转录组比较分析、寄生表型相关基因鉴定等研究,含补充信息压缩包与说明文档。 文件详解 Supplementary_Information.zip 文件格式:ZIP...
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  • Dryad_植物病原菌_青枯菌噬菌体抗性毒力权衡实验数据

    2026年1月30日 30 24 18

    数据集概述 本数据集记录青枯菌(Ralstonia solanacearum)在25℃和35℃环境下,噬菌体选择压力对其抗性-毒力权衡及分子机制的影响实验结果,包含进化菌株的表型、基因型特征及转录组相关数据,共2个文件。 文件详解 README.md 文件格式:MD...
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  • 唐松草属植物转录组比较研究及CYP719A基因进化数据分析

    2026年1月30日 30 68 63

    数据集概述 本数据集包含两种鬼臼属(Dysosma)物种的比较转录组资源及鬼臼亚科(Podophylloideae)中CYP719A基因的分子进化数据。通过高通量测序获取高海拔物种D. aurantiocaulis的转录组,与低海拔物种D. versipellis进行比较分析,识别直系同源基因并研究其选择压力,同时开发EST-...
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  • GEO_Based_神经退行性或感染性疾病转录组研究数据集

    2026年1月30日 30 35 2

    数据集概述 本数据集是Gene Expression Omnibus(GEO)平台上与神经退行性或感染性疾病相关的转录组研究集合,包含研究编号、疾病类型、技术平台、样本类型、PubMed ID、对照样本及扰动样本等核心信息,部分文件含Wikidata ID映射。数据集由4个文件组成,支持生物医学领域的疾病相关基因表达研究。 文件详解 原始数据文件...
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  • LFQ_Results_Based_蛋白质组学定量分析数据

    2026年1月30日 30 48 5

    数据集概述 本数据集包含蛋白质组学研究中的LFQ(Label-Free Quantification,无标记定量)结果数据,以单一Excel文件形式存储,未进行训练测试、数据标签或原始/处理数据的拆分,文件类型统一为.xlsx格式。 文件详解 文件名称:CombinedList_LFQ_Results.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Common_bean_PvIND基因座亚硫酸氢盐测序数据

    2026年1月29日 30 46 26

    数据集概述 本数据集包含普通菜豆PvIND基因座的亚硫酸氢盐测序数据,用于研究豆荚纤维沉积相关的表观遗传调控机制。数据源于对普通菜豆荚果发育过程中PvIND基因表达及DNA甲基化状态的分析,涉及转录组、解剖学、表观遗传学及遗传学等多维度研究,旨在揭示豆荚纤维沉积的可逆性表型调控机制。 文件详解 文件名称:README_file.txt 文件格式:TXT...
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  • Cohesin_Based_染色质折叠与转录组扰动综合实验数据

    2026年1月29日 30 204 2

    数据集概述 本数据集聚焦Cohesin及其相关因子对染色质折叠和转录组的调控作用,通过因子耗竭实验获取3D基因组、转录组及表观基因组数据,分析其对拓扑关联结构域(TAD)边界、基因表达的影响,揭示Cohesin在染色质结构与基因表达中的上下文特异性功能。 文件详解 文件名称:RPE_Hi-C_Analysis_v2.2.0.zip 文件格式:ZIP...
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