数据集概述
本数据集为莱茵衣藻实验室菌株的基因组资源数据，通过全基因组重测序分析39株常用实验室菌株的遗传多样性，识别出524,640个单核苷酸变异和4812个结构变异，揭示菌株间存在两种交替单倍型的镶嵌模式，为藻类研究提供遗传差异资源。
文件详解
- 单核苷酸变异文件
- 文件名称：tpc00508-SupplementalDS2.vcf.zip、tpc00508-SupplementalDS3.vcf.zip
- 文件格式：VCF（压缩包）
- 字段映射介绍：包含菌株间的单核苷酸变异信息
- 结构变异文件
- 文件名称：tpc00508-SupplementalDS5.bed
- 文件格式：BED
- 字段映射介绍：记录菌株的结构变异信息
- 表格数据文件
- 文件名称：tpc00508-SupplementalDS1.xlsx、tpc00508-SupplementalDS4.xlsx、tpc00508-SupplementalDS6.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基因组分析相关的结构化数据，如单倍型分布、菌株遗传关系等信息
数据来源
论文“Chlamydomonas genome resource for laboratory strains reveals a mosaic of sequence variation, identifies true strain histories, and enables strain-specific studies”
适用场景
- 藻类基因组多样性研究: 分析莱茵衣藻实验室菌株的遗传变异类型与分布规律
- 菌株遗传关系解析: 利用单倍型指纹识别菌株身份及其亲缘关系
- 表型差异机制探究: 关联遗传变异与菌株表型差异，揭示表型背后的分子基础
- 实验设计优化: 为莱茵衣藻相关实验提供菌株遗传背景参考，提升实验准确性与可重复性
- 藻类生物学研究: 支持光合作用、纤毛功能、生物燃料等领域的藻类分子机制研究
