数据集概述
本数据集提供了通过CRISPR干扰（CRISPRi）与条形码表达报告基因测序（CiBER-seq）结合技术，在人类细胞中进行全基因组扰动后转录响应的定量测量数据。数据用于解析核因子κB（NF-κB）信号通路等调控网络，展示了CiBER-seq技术在哺乳动物细胞遗传网络研究中的应用价值。
文件详解
- 文件名称：
raw-data-and-analysis.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包包含全基因组CRISPRi扰动实验的原始数据及分析文件，具体内容未提供预览，推测涵盖sgRNA文库信息、转录组测序原始数据、NF-κB报告基因活性定量结果等核心实验数据。
数据来源
论文“CRISPRi with barcoded expression reporters dissects regulatory networks in human cells”
适用场景
- 基因调控网络解析: 用于研究人类细胞中CRISPRi介导的基因扰动对转录组的影响，解析NF-κB等信号通路的调控机制。
- 转录组响应分析: 利用CiBER-seq技术捕获的转录响应数据，研究基因表达调控的动态过程。
- 细胞类型特异性因子研究: 分析不同细胞类型中基因调控网络的差异及关键调控因子。
- 基因工程技术优化: 为CRISPRi与条形码报告基因结合技术的进一步优化提供实验数据支持。
