数据集概述
本数据集为Cinchona pubescens的转录组数据,围绕奎宁生物合成的酶学基础展开研究。通过分析该植物的转录组数据,发现了参与奎宁生物合成途径早期和晚期步骤的三种关键酶,为理解奎宁合成机制提供了基因表达层面的支持。
文件详解
- Read_me.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:文档类文件,推测包含数据集的说明性内容(具体内容未提供预览)
- Cinchona.All.GeneExpression.FPKM_.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:数据类文件,包含Cinchona pubescens所有基因的FPKM(每千碱基转录本每百万映射读数)表达量数据
- Cinchona_All-Unigene.fa
- 文件格式:FA
- 字段映射介绍:其他类文件,包含Cinchona pubescens的所有Unigene(单一基因转录本)序列数据
适用场景
- 植物基因表达分析: 利用FPKM数据研究Cinchona pubescens中基因的表达水平与奎宁合成的关联
- 奎宁生物合成机制研究: 通过转录组数据探索参与奎宁合成的关键酶基因及其功能
- 植物分子生物学研究: 分析Cinchona pubescens的Unigene序列,开展基因注释、功能分类等基础研究
- 药用植物代谢途径解析: 基于转录组数据挖掘药用植物中活性成分(如奎宁)的生物合成相关基因