数据集概述
本数据集是论文《Micrathena蜘蛛完整系统发育揭示新热带区雨林、岛屿与陆块间的多次扩散事件及安第斯造山运动促进物种形成》的补充图表与数据，包含补充图S1-S15及补充数据S16-S44，涵盖标本信息、形态与分子序列数据、系统发育分析输入文件、生物地理学分析结果等，支撑蜘蛛系统发育与生物地理学研究。
文件详解
- 补充图表
- 文件名称：
S1–S15 Supplementary Figures.pdf
- 文件格式：PDF
- 字段映射介绍：包含15张补充图，支撑论文中的系统发育与生物地理学分析结果
- 标本与形态数据
- 文件名称：
S16_vouchers_morphology.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：形态学评分 voucher 标本完整数据
- 文件名称：
S17_morphological_matrix.ss
- 文件格式：SS
- 字段映射介绍：含形态学评分的离散特征矩阵（Nexus格式相关）
- DNA标本与序列数据
- 文件名称：
S18_DNA_voucher_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：DNA测序 voucher 标本完整数据
- 文件名称：
S19_alignment-COI.fas、S20_alignment-H3.fas、S21_alignment-28S.fas、S22_alignment-ITS.fas、S23_alignment-16S.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：细胞色素氧化酶I、组蛋白H3、28S核糖体、内转录间隔区、16S核糖体序列的比对数据
- 系统发育分析输入文件（多个ZIP压缩包及独立文件）
- 包含IQ-Tree、MrBayes、BEAST等工具的形态学、序列数据（Muscle/MAFFT比对）、总证据分析的输入文件，格式涉及Nexus、XML、Bayes、文本命令文件等
- 生物地理学与统计分析文件
- 文件名称：
S33_distribution_maps.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：含所有Micrathena物种分布地图、原始记录数据库及生成地图的R脚本
- 包含生物地理学随机映射、GeoHiSSE分析、模型比较结果等的R脚本、CSV数据、Excel表格
- 结果文件
- 文件名称：
S38_summary_trees.zip、S39_BioGeoBEARS_results.zip等
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：系统发育分析最优树、BioGeoBEARS竞争模型下的祖先范围估计结果
数据来源
论文“Complete phylogeny of Micrathena spiders suggests multiple dispersal events among Neotropical rainforests, islands, and landmasses, and indicates Andean orogeny promotes speciation”（提交至Cladistics）
适用场景
- 蜘蛛系统发育研究: 利用形态与分子序列数据及系统发育分析输入文件，重建Micrathena蜘蛛的演化关系
- 生物地理学分析: 通过分布地图、祖先范围估计结果，探究新热带区蜘蛛的扩散事件与地理隔离机制
- 物种形成机制研究: 结合安第斯造山运动相关分析，探讨地质事件对Micrathena蜘蛛物种形成的促进作用
- 分子生态学研究: 利用DNA序列比对数据与标本信息，分析蜘蛛种群的遗传多样性与演化历史
- 生物统计模型验证: 通过生物地理学模型比较结果，优化物种分布与演化的统计模型构建
