找到58个数据集

标签: BEAST

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  • Euphorbia_Based_大戟属植物进化爆发与光合途径关联研究数据

    2026年1月22日 30 158 95

    数据集概述 本数据集围绕大戟属植物进化爆发与光合途径的关联展开,包含分子系统发育分析相关文件。研究聚焦中新世大气CO₂水平下降背景下,CAM和C4光合途径的进化对大戟属多样化的影响,揭示了光合途径与物种分化速率的关系,为理解植物适应干旱环境的进化机制提供数据支持。 文件详解 Euphorbia10markerComplete.nex 文件格式:NEX...
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  • Doedicurus_Based_南美巨型雕齿兽古DNA进化关系研究数据

    2026年1月21日 30 83 68

    数据集概述 本数据集包含已灭绝南美巨型雕齿兽(Doedicurus sp.)的古DNA研究相关数据,涉及雕齿兽及现存犰狳的测序数据、系统发育分析文件、NGS流程脚本等,用于揭示雕齿兽的进化起源与系统发育关系,支持古生物进化研究。 文件详解 测序数据文件...
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  • Claravis_Based_新世界地鸠分子系统发育与羽色状态演化研究数据

    2026年1月21日 30 135 37

    数据集概述 本数据集包含新世界小型地鸠Claravis属的完整分子系统发育研究相关文件,涉及三个物种的线粒体和核基因位点序列数据,通过系统发育树构建和祖先状态重建方法,分析该属的并系性及雄性蓝色羽色(性二态性)的演化历史。数据集共5个文件,涵盖序列比对、系统发育树和分析配置文件。 文件详解 序列比对文件...
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  • Cardioglossa_Based非洲长指蛙属系统发育与物种分化研究数据

    2026年1月21日 30 2 1

    数据集概述 本数据集包含非洲长指蛙属(Cardioglossa)18个物种的系统发育分析相关文件,基于线粒体和核基因位点数据构建。涵盖系统发育树、分区方案、物种界定分析等结果,支持研究该属物种的分化时间、生物地理历史及体色分化机制,共8个文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre)...
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  • TipDatingBeast_Based_系统发育末端定年测试辅助工具数据

    2026年1月21日 30 84 0

    数据集概述 本数据集为R包TipDatingBeast的辅助数据,支持使用BEAST进行系统发育末端定年测试。数据包含两种核心功能相关文件:用于日期随机化分析的XML配置文件,以及用于留一法分析的日志压缩文件,可辅助评估数据集时间信号、校准序列一致性及潜在偏差。 文件详解 XML配置文件(共2个)...
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  • Symbiodiniaceae_Based珊瑚共生藻系统修订与进化研究数据

    2026年1月21日 30 136 133

    数据集概述 本数据集为珊瑚共生藻科(Symbiodiniaceae)系统修订研究的配套数据,包含分子序列、系统发育分析输入文件、遗传与形态学分析代码及结果日志等,支撑对该科进化历史、多样性及与珊瑚共生关系的研究,涉及中生代约1.6亿年前的分化时间校准等关键结论。 文件详解 分子序列文件(.nexus格式)...
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  • Megalobrachium_Based_中美地峡隆起与海洋物种形成研究数据

    2026年1月20日 30 153 73

    数据集概述 本数据集围绕中美地峡隆起过程中海洋新热带浅水物种的演化展开,聚焦异尾蟹属Megalobrachium的物种形成机制。通过分析该属13个已知物种及3个潜在新物种的线粒体与核基因序列,构建时间校准的系统发育树,结合祖先区域重建探讨其历史生物地理过程,揭示中美地峡形成对物种分化的影响。 文件详解...
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  • SARS_CoV_2_Colombia_疫情变异株竞争研究_补充数据_2022

    2026年1月20日 0 79 37

    数据集概述 本数据集是论文《The principles of SARS-CoV-2 inter-variant competition are exemplified in the pre-Omicron era of the Colombian epidemic》的补充数据,包含研究中使用的BEAST...
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  • phylogeography_Taiwan_特有蝙蝠物种比较系统地理学研究数据

    2026年1月19日 30 143 50

    数据集概述 本数据集包含台湾四种特有森林依赖型蝙蝠(高山 specialists 灰伏翼、低山 specialists 隐伏翼与 Kerivoula sp.、广海拔 generalist 普氏伏翼)的比较系统地理学研究数据,结合种群遗传分析与物种分布模型(SDM),探究海拔、气候等非生物因素与物种特性对种群遗传结构的影响,共含9个文件。 文件详解...
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  • Galápagos_Serpentes_Dipsadidae_蛇类辐射演化研究数据

    2026年1月18日 30 116 81

    数据集概述 本数据集围绕加拉帕戈斯蛇类辐射演化研究展开,包含系统发育分析相关的序列比对、字符集定义及时间校准树文件,支持揭示该类群的起源与隐藏多样性,涉及Pseudalsophis属等物种的分类与演化研究,共7个文件。 文件详解 系统发育分析文件...
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  • Trigonopterus_Source_Wallace线象鼻虫生物地理学研究数据集

    2026年1月18日 30 63 6

    数据集概述 本数据集围绕象鼻虫属Trigonopterus跨Wallace线的生物地理学研究展开,包含基于303个物种的系统发育分析、生活方式转变及分布模式的相关数据,涉及系统发育树、基因超矩阵、栖息地数据等10个文件,用于探究该属跨Wallace线的扩散事件及生态适应机制。 文件详解 基因超矩阵文件 文件名称:Sula_smatrix.307.fas...
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  • Hawkmoth_Dryad_Based_反蝙蝠超声产生与声纳干扰行为及系统发育数据

    2026年1月18日 30 54 23

    数据集概述 本数据集聚焦天蛾与蝙蝠的协同进化关系,包含124种天蛾对蝙蝠声纳攻击的超声响应行为数据、蝙蝠-天蛾捕食实验结果,以及基于多基因构建的化石校准系统发育树。数据覆盖天蛾超声产生的功能验证(声纳干扰)和进化历史分析,涉及约1500种天蛾的防御策略起源与分化时间研究。 文件详解 系统发育树文件...
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  • Trilobite_Evolutionary_Rates_寒武纪大爆发持续时间研究数据

    2026年1月14日 30 37 8

    数据集概述 本数据集为三叶虫进化速率与寒武纪大爆发持续时间研究的配套数据,包含三叶虫分类单元、年代信息、形态特征数据及相关分析文件。通过贝叶斯尖端定年法分析,验证三叶虫寒武纪起源及进化速率稳定性,为寒武纪大爆发已在约5.21亿年前基本结束的结论提供量化证据。 文件详解 文件名称:Dataset_1_Taxa,Dates,CodingRefs.xlsx...
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  • Haringtonhippus_NewGenus_更新世北美洲马新属基因组与形态测量研究数据

    2026年1月17日 30 99 64

    数据集概述 本数据集包含更新世北美洲NWSL马的线粒体基因组、部分核基因组及形态测量分析数据,支持其单种属分类及新属Haringtonhippus的命名。通过基因组与形态测量结合分析,明确该马类不属于现生马属,为晚更新世灭绝事件研究提供依据,含60个相关分析文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,38个)...
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  • Hemidactylus_Socotra_Archipelago_壁虎起源与原地分化研究数据

    2026年1月17日 30 154 87

    数据集概述 本数据集包含索科特拉群岛半叶趾虎属壁虎起源与原地分化研究的分子数据,涵盖线粒体和核基因位点的单倍型序列、GenBank信息表及物种树分析文件,共10个文件,用于探究该属壁虎的生物地理历史、进化模式及种内遗传多样性。 文件详解 基因序列文件(.fasta格式,共9个) 单倍型序列文件:包括hemi_soc_prdx4_all-...
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  • Nedubini_Based_近北极螽斯系统发育研究基因序列与分析文件_原始数据

    2026年1月15日 30 60 50

    数据集概述 本数据集为近北极盾背螽斯(“Tettigoniinae”)系统发育研究的相关文件,包含5个基因区域的序列数据及系统发育分析文件。研究通过贝叶斯和似然法分析,明确近北极Nedubini为螽斯科基部分支,为理解螽斯演化及北美残遗类群分布提供数据支持,共含3个文件。 文件详解 Project33rdBEAST_wfossils copy.xml...
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  • Dryad_Based_Distephanus属分子系统发育与新分类单元研究数据

    2026年1月15日 30 103 86

    数据集概述 本数据集为Distephanus属分子系统发育研究的配套数据,包含4个核基因组和质体基因组分子标记的多序列比对文件、生物地理分析脚本、地理数据及时间校准分化时间分析配置文件,共8个文件。数据支持验证Distephanus属单系性、划分新分类单元Distephaneae族的研究结论。 文件详解 序列比对文件(.fasta格式)...
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  • Hymenoptera_UCE_Based_叶蜂与树蜂系统发育及生物地理学研究数据

    2026年1月15日 30 77 14

    数据集概述 本数据集包含叶蜂与树蜂(膜翅目)系统发育与生物地理学研究的输入文件、分析脚本及系统发育树文件,用于构建该类群的综合系统发育关系并解析其生物地理历史,共包含40个文件。 文件详解 输入文件 文件名称:BEAST_input_phylo-...
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  • Certhioidea_Based_美洲鹪鹩及其近缘类群系统发育与生物地理历史数据

    2026年1月14日 30 205 25

    数据集概述 本数据集包含雀形目Certhioidea超科(鹪鹩及其近缘类群)的系统发育与生物地理分析数据,覆盖物种及种系水平采样,涉及分子超级矩阵构建、系统发育树推断、生物地理历史重建及多样化速率分析等内容,为研究该类群在美洲的分化与扩散历史提供基础框架。 文件详解 系统发育树文件(.tre)...
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  • FMDV_SAT1_SAT2_Based东非口蹄疫病毒系统地理与跨物种传播动态研究数据

    2026年1月14日 30 120 76

    数据集概述 本数据集聚焦东非地区SAT1和SAT2型口蹄疫病毒(FMDV)的进化流行病学,分析1975-2016年病毒在牛与野生非洲水牛间的跨物种传播动态。通过贝叶斯系统动力学模型解析VP1基因片段,推断病毒祖先位置、传播路线及宿主来源,为非洲口蹄疫防控提供科学依据,包含9个相关分析文件。 文件详解 SAT1相关文件...
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