数据集概述
本数据集围绕蜂鸟线粒体编码的细胞色素c氧化酶亚基I（COI）中独特的氨基酸替代展开，包含相关物种的基因序列、进化分析文件及结构模拟支持数据，共34个文件，主要用于探究该替代对质子通道功能及蜂鸟高代谢能力的影响。
文件详解
- 基因序列文件（.fasta格式，29个）
- 文件名称示例：Table_S8_(Eristalis_BOLD_MAFFT_auto).fasta、Table_S7_(Andrenidae_BOLD_COI-5P_MAFFT_auto).fasta
- 字段映射介绍：包含不同物种（如蜂鸟、昆虫等）的COI基因序列数据，用于序列比对与进化分析
- 表格与序列汇总文件（.xlsx格式，2个）
- 文件名称示例：Figure_1A_and_Table_S1_and_Figure_1B_(Accession_by_Species_Aves)_RefSeq_JAN7_2019.xlsx
- 字段映射介绍：汇总鸟类物种的基因登录号、序列信息等结构化数据
- 进化树文件（.nwk格式，1个）
- 文件名称：Figure_1A_and_Table_S1_and_Figure_1B_(Aves_mtProt_NoDups_Clean_TCOFF_G)_RefSeq_JAN7_2019.nwk
- 字段映射介绍：鸟类线粒体蛋白的系统发育树结构数据
- 进化分析辅助文件（.fas、.anctree格式，各1个）
- 文件名称示例：Figure_1A_and_Table_S1_and_Figure_1B_(Aves_mtProt_NoDups_Clean_TCOFF_G_PAGAN).fas
- 字段映射介绍：包含用于构建进化树的序列数据及树结构注释信息
数据来源
论文“An unusual amino acid substitution within hummingbird cytochrome c oxidase alters a key proton-conducting channel”
适用场景
- 线粒体基因进化研究: 分析蜂鸟COI基因中独特氨基酸替代的进化起源与保守性
- 生物能量代谢机制探究: 研究该氨基酸替代对细胞色素c氧化酶质子通道功能及蜂鸟高代谢能力的影响
- 分子结构功能分析: 结合结构模拟数据，解析氨基酸替代对蛋白质结构与质子传导效率的调控机制
- 跨物种比较基因组学: 通过不同物种的COI序列比对，探究该替代的物种特异性与适应性意义
