数据集概述
本数据集围绕Colletotrichum属真菌的半活体营养阶段转变展开，包含C. orbiculare和C. gloeosporioides两种病原菌的基因组测序与分析结果。通过比较基因组学和转录组学方法，识别与病原菌侵染阶段相关的基因扩张类群，揭示其致病机制。数据集含4个文件，涵盖基因组组装说明文档与压缩包。
文件详解
- 文档文件（.txt格式）
- 文件名称：README_for_Colletotrichum_gloeosporioides_Nara_gc5_1_assembly.txt、README_for_Colletotrichum_orbiculare_104T_MAFF_240422_1_assembly.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录基因组组装信息，包括组装工具（如SOAPdenovo）、基因组序列文件（.fasta格式）、预测蛋白质序列文件、预测转录本序列文件等内容。
- 压缩包文件（.zip格式）
- 文件名称：Colletotrichum_gloeosporioides_Nara_gc5_1_assembly.zip、Colletotrichum_orbiculare_104T_MAFF_240422_1_assembly.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含基因组组装相关的序列文件，推测涵盖基因组 scaffolds/contigs、预测蛋白质及转录本序列等数据。
数据来源
论文“Comparative genomic and transcriptomic analyses reveal the hemibiotrophic stage shift of Colletotrichum fungi”
适用场景
- 植物病原菌致病机制研究: 分析Colletotrichum属真菌半活体营养阶段转变的基因表达特征，识别致病相关基因。
- 比较基因组学分析: 对比C. orbiculare与C. gloeosporioides基因组差异，探究宿主范围与致病性关联。
- 农业病害防控: 基于基因扩张类群与阶段特异性表达数据，开发病害诊断或防控靶点。
- 转录组学研究: 参考侵染过程中基因表达谱，解析病原菌与宿主互作的分子机制。
