数据集概述
本数据集为异养兰花Corallorhiza striata复合群的谱系与整合分类研究数据，包含基因组、形态、物候、繁殖模式、生态位及真菌宿主等多源数据，采用“谱系+生态角色”方法分析物种界定，涉及13个文件，覆盖序列比对、SNP数据、形态统计、开花时间等内容。
文件详解
- 基因组相关文件
- Dataset_S1_rbcL_alignment.fasta（FASTA格式）：rbcL基因序列比对数据
- Dataset_S2_ISSRseq_filtered_variants.vcf（VCF格式）：过滤后的ISSRseq变异位点数据
- Dataset_S3_thinned.recode.vcf（VCF格式）： thinning处理后的VCF数据
- Dataset_S4_ISSRseq_SNPs.nexus（NEXUS格式）：ISSRseq SNPs数据
- Dataset_S5_Cor_striata_ssrgenotyper_06pop.gen（GEN格式）：SSR基因型数据
- 形态与物候数据
- Dataset_S6_morphology_PAST.dat（DAT格式）：形态学分析数据
- Dataset_S7_flowering_times_gbif.csv（CSV格式）：基于GBIF的开花时间数据
- Dataset_S8_fruit_set_herbarium_records.csv（CSV格式）：标本馆记录的结果率数据
- 生态与真菌数据
- Dataset_S9_BIOCLIM.csv（CSV格式）：BIOCLIM生态位数据
- Dataset_S10__fungal_ITS_alignment_edited.fasta（FASTA格式）：真菌ITS序列比对数据
- 分析结果与图表
- Table_S6_assignPop_PP.docx（DOCX格式）：种群分配概率表格
- bbb_Fig_S1_DAPC_snps_msats.eps（EPS格式）：DAPC分析结果图表
- bbb_Fig_S2_ITSF_randomization_Rplot_discrete copy.eps（EPS格式）：ITSF随机化分析图表
适用场景
- 植物分类学研究：用于Corallorhiza striata复合群的物种界定与分类单元划分
- 谱系地理学分析：基于基因组数据探究种群遗传结构与演化历史
- 生态位分化研究：结合BIOCLIM数据分析不同谱系的生态位差异
- 真菌-宿主互作研究：通过真菌ITS序列分析兰花与真菌的共生关系
- 形态与物候特征分析：利用形态数据和开花时间数据研究表型分化
- 整合分类方法应用：验证“谱系+生态角色”物种界定方法的实践效果
