数据集概述
本数据集围绕加州淡水杜父鱼姐妹类群(Cottus gulosus和C. pitensis)的系统地理学与历史杂交研究展开,包含遗传标记分析结果、基因型数据及物种树文件,支持验证物种分布范围、杂交事件及系统地理断裂的研究假设,共9个文件。
文件详解
- 物种树与遗传树文件
- 文件名称:SpeciesTree_Newick、usat_outtree_cse、usat_outtree_nei、usat_outtree_rey
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:包含基于不同遗传标记(核基因、线粒体、微卫星)构建的物种系统发育树与种群遗传树,记录类群进化关系与遗传距离
- 遗传序列与标记文件
- 文件名称:520.txt、508.txt、517.txt、CB.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:存储线粒体、核基因等遗传序列数据及标记位点信息,如520.txt包含碱基序列与位点编号
- 基因型数据文件
- 文件名称:Baumsteiger_usat_genotypes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录微卫星标记的基因型数据,包含样本编号、位点基因型等信息,支持种群遗传结构分析
数据来源
论文“Complex phylogeography and historical hybridization between sister taxa of freshwater sculpin (Cottus)”
适用场景
- 淡水鱼类系统地理学研究:分析Cottus属姐妹类群的进化断裂、种群结构与地理景观的关联
- 物种杂交与基因流分析:验证姐妹类群间的历史杂交事件及当前基因交流模式
- 生物多样性保护评估:识别受人类活动影响的独特谱系(如圣华金盆地C. gulosus),为保护目标确定提供依据
- 遗传标记应用研究:比较核基因、线粒体、微卫星标记在系统地理分析中的效果差异
- 进化生态学分析:探究地理屏障(如海岸山脉、河流汇合处)对淡水鱼类进化分化的影响机制