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标签: 物种树

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  • 异源多倍体同源基因亲本基因组分配与物种树推断数据集_烟堇属案例

    2025年12月7日 30 81 48

    数据集概述 本数据集围绕异源多倍体物种中同源基因向亲本基因组的分配方法展开,旨在解决复杂进化历史下的物种树推断问题。以植物烟堇属(罂粟科)为研究案例,包含用于基因组系统发育分析的序列比对文件及补充说明文档,为多倍体物种的网状进化关系研究提供数据支持。 文件详解 核心序列文件(.nex格式):...
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  • 真菌界转座元件共选择补充数据集

    2025年12月6日 30 56 34

    数据集概述 该数据集为博士论文第三章的补充文件,围绕真菌界转座元件的共选择研究展开,包含物种元数据、融合候选基因、PFAM结构域等相关补充表格及说明文档,支持对真菌转座元件功能及进化机制的分析。 文件详解 该数据集包含10个文件,具体说明如下: - 文本表格文件(.txt格式,共7个): -...
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  • BEAST计算性能与统计准确性及方法比较数据集

    2025年12月6日 30 2 1

    数据集概述 本数据集围绕多物种溯祖模型下*BEAST方法的计算性能与统计准确性展开,通过模拟研究分析其与其他系统发育方法(如超级矩阵拼接法)的差异,探究基因座数量、分支长度等参数对结果的影响,为贝叶斯物种树估计的实践应用提供数据支持。 文件详解 New Supplementary...
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  • 贝叶斯超级树模型基因组物种树重建数据集

    2025年12月6日 30 42 15

    数据集概述 该数据集围绕贝叶斯超级树模型展开,用于从全基因组数据中重建物种树,可处理基因树与物种树不一致的多源问题,无需识别直系同源基因或单物种个体,包含模拟数据、果蝇数据及补充图表。 文件详解 文件名称:drosophila.txz,文件格式:.txz,为果蝇相关数据压缩包,包含用于物种树重建的果蝇基因组数据...
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  • 大麦属物种水平系统发育与多倍体关系数据集

    2025年12月6日 30 153 24

    数据集概述 本数据集围绕大麦属(Hordeum)物种的系统发育及多倍体关系展开,通过结合PCR与下一代测序技术,对13个基因座(含1个叶绿体基因和12个核单拷贝基因座)的序列数据进行分析,首次在单一分析中揭示所有二倍体和多倍体大麦属物种的系统发育及祖裔关系。 文件详解 文档文件:...
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  • TreeFix基因树错误校正方法数据集

    2025年12月5日 30 201 168

    数据集概述 本数据集围绕TreeFix方法展开,该方法结合序列数据与物种树信息,用于改进基因树重建。通过最小化基于物种树的代价函数,TreeFix可找到与输入基因树“统计等效”的校正基因树,提升重建准确性。 文件详解 文件名称: supp.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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