-
斑点蛙属物种系统发育树_核与线粒体DNA数据分析
2026年2月9日 30 163 77
数据集概述 本数据集包含北美拟蝗蛙属（Pseudacris）物种树估计研究的相关数据，采用简化基因组文库方法开发标记，通过Illumina MiSeq平台进行平行标记扩增子测序，涉及27个核基因座和3个线粒体基因座的44个个体样本，可用于分析基因树异质性、核质基因不一致性及物种系统发育关系。 文件详解 代码文件...
-
Cognettia_Based北欧陆地蠕虫隐存多样性分子分析数据
2026年2月9日 30 22 6
数据集概述 本数据集为北欧陆地蠕虫Cognettia sphagnetorum隐存多样性研究的分子数据，包含4个分子标记（线粒体COI、16S及核基因H3、ITS）的序列文件、贝叶斯推断单基因树及多物种溯祖物种树相关文件，共39个文件，用于分析该属的分类地位与隐存种划分。 文件详解 分子标记序列与分区文件...
-
真菌基因转移数据的基因组规模系统发育分析
2026年2月2日 30 37 12
数据集概述 本数据集为真菌基因组规模系统发育分析相关数据，包含基因家族选择、序列比对结果、基因树与物种树整合计算输出等内容，用于探究基因转移在真菌进化中的作用，支持比较基因组进化动力学研究，共含六个文件。 文件详解 README_for_TreeAConcatenate.txt 文件格式：TXT...
-
Sclerobunus属综合分类学与物种界定数据
2026年2月1日 30 147 130
数据集概述 本数据集围绕北美西部山区Sclerobunus属盲蛛的综合分类与物种界定展开，通过形态学分析与遗传学验证结合的方法，完成属级分类修订，包括属的合并、亚种升级及新物种描述，为该类群的物种多样性研究提供数据支持。 文件详解 Sclerobunus_SpeciesTree_Derkarabetian&Hedin2014.tre...
-
SuperFine_Source_超级树估计方法_数据
2026年1月31日 30 45 44
数据集概述 本数据集包含SuperFine方法的相关数据，SuperFine是一种用于提高超级树方法准确性和可扩展性的元方法。数据集涉及超级树估计的模拟和实证研究，旨在解决大型物种树估计的计算挑战，包含2个文件，文件类型为.txt和.zip。 文件详解...
-
ASTRAL_Source_基因组规模物种树估计数据集
2026年1月31日 30 55 32
数据集概述 本数据集为ASTRAL方法（一种基于多物种溯祖模型的基因组规模物种树估计方法）相关的研究数据，包含模拟与生物学数据集，用于支持物种树估计的准确性验证与方法比较，共6个文件，涵盖说明文档、真实树、模拟脚本、序列数据、估计基因树及生物学数据等类型。 文件详解 文件名称：README.md 文件格式：MD...
-
SimPhy_Based_物种树推断方法模拟配置脚本数据
2026年1月30日 30 187 20
数据集概述 本数据集包含用于系统发育模拟研究的SimPhy配置脚本压缩包，支持探究物种树推断方法在存在旁系同源（paralogy）和/或不完全谱系分选（ILS）情况下的鲁棒性。研究通过模拟及生物数据集分析，验证ILS感知方法处理旁系同源数据的准确性，扩展可用分析位点数量。 文件详解 文件名称：simphy-configuration-files.zip...
-
DRYAD_Based_C4光合作用新基因平行进化研究数据
2026年1月30日 30 148 20
数据集概述 本数据集包含C4光合作用新基因平行进化研究的相关文件，涉及两种C4光合作用起源中基因复制的独立平行进化机制，重点分析维管束鞘细胞优先表达基因及SWEET-13转运蛋白的功能，为C4植物韧皮部装载机制提供新见解。 文件详解 README_for_Trees.txt 文件格式：TXT...
-
Calicina_加州短程特有盲蛛辐射演化古生物地理学研究数据
2026年1月28日 30 151 76
数据集概述 本数据集围绕加州Calicina属25种短程特有盲蛛展开，包含21个物种的多基因校准物种树、形态数据及环境变量数据，用于重建该蛛形纲支系的时空生物地理历史，分析形态演化与环境变量的关系，揭示其从内华达山脉到海岸山脉的迁徙及趋同演化模式。 文件详解 基因序列文件（共3个）...
-
GPWG_III_Based_禾本科系统发育分析全流程数据仓库
2026年1月28日 30 13 8
数据集概述 本数据集是禾本科系统发育研究工作组III（GPWG III）的数据仓库，包含基于核基因（Angiosperm353基因集）和质体数据的禾本科系统发育分析数据，涉及1153个样本（对应1133个接受种）。数据涵盖元数据、核基因分析结果、基因树-物种树...
-
代谢组学引导的基因组比较研究_哺乳动物冬眠基因趋同进化数据分析
2026年1月28日 30 96 48
数据集概述 本数据集配套“Genes Underlying Adaptive Physiological Shifts Among Hibernating Mammals”手稿，包含基因组、系统发育及功能富集数据，用于研究哺乳动物冬眠相关性状（尤其是肉碱代谢）的进化机制，覆盖物种树、基因树、功能富集等多类型资源。 文件详解 系统发育资源...
-
Polypteridae_Based多鳍鱼谱系多样化研究数据集
2026年1月28日 30 31 26
数据集概述 本数据集围绕多鳍鱼（Polypteridae）谱系的多样化历史展开，结合化石记录与分子系统发育信息，探究这一古老类群在漫长进化过程中的“繁荣-衰退”模式，揭示物种贫乏谱系长期存续的机制，挑战“活化石”进化停滞的传统认知。 文件详解...
-
Marmosops_Based新热带区鼠负鼠亚属物种边界研究数据
2026年1月28日 30 43 28
数据集概述 本数据集围绕新热带区鼠负鼠亚属Marmosops的物种边界研究，包含多基因位点（12个核基因座、1个线粒体基因座）的遗传数据及物种界定分析结果，用于验证13个隐存线粒体单倍型类群的进化独立性，为该类群的分类修订提供依据。 文件详解 1.Data.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：包含研究使用的多基因位点原始数据...
-
RevBayes_Based_多态感知物种树与进化力估计补充数据
2026年1月28日 30 128 115
数据集概述 本数据集为论文《Polymorphism-aware estimation of species trees and evolutionary forces from genomic sequences with...
-
Squamata_Based_有鳞目基因组规模数据系统发育分析数据集
2026年1月26日 30 135 71
数据集概述 本数据集基于289个样本的高通量测序数据，覆盖75个有鳞目科，用于分析其系统发育关系、估算分化时间及评估拓扑不确定性。重点验证传统形态学分类群（如Scleroglossa和Macrostomata）的基因组支持度，探讨基因树与物种树不一致的原因，包含23个相关文件。 文件详解 文档类文件 文件名称：Fig_S1_Phylogenetic...
-
Dryad_Based_南非Memecylon属植物网状进化研究数据
2026年1月25日 30 116 81
数据集概述 本数据集为南非Memecylon属植物进化研究相关数据，包含基因树、物种树、序列比对、分区文件等多种类型文件，用于探究该属植物类群的系统发育关系、基因流及网状进化证据，支持植物分类学与进化生物学研究。 文件详解 Dryad_ReadMe.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据背景、使用方法等信息...
-
Psoralea_Based_豆科Psoralea属分类学研究数据集
2026年1月25日 30 167 158
数据集概述 本数据集是豆科Psoralea属分类学研究的配套文件，包含系统发育分析相关的样本信息、数据处理结果及进化树文件。数据支撑Psoralea属的分类修订研究，涵盖样本ENA登录号、缺失数据与旁系同源基因统计、位点共识序列、比对序列、基因树及物种树等内容，共7个文件。 文件详解 1_Appendix...
-
turtle_genomic_Based龟类进化多样化基因组研究数据
2026年1月25日 30 206 137
数据集概述 本数据集为龟类进化多样化的基因组研究数据，包含19个代表性龟类基因组的单拷贝直系同源基因、26个龟类物种的二代测序标记，以及系统发育分析结果。数据用于探究龟类进化中的系统发育异质性、基因树-物种树冲突等问题，共17个文件，涵盖对齐序列、基因树、物种树、日志及补充表格等内容。 文件详解 压缩包文件（.zip/.tar.gz）...
-
DeGiorgioDegnan_Based_物种树推断稳健性研究数据
2026年1月23日 30 194 6
数据集概述 本数据集围绕物种树推断的稳健性展开，对比MP-EST、STAR、STEAC、STELLS和STEM等方法在处理最大似然与贝叶斯基因树时的表现，分析分歧时间低估对推断准确性的影响，包含1个压缩文件，用于系统发育方法的性能评估与误差机制研究。 文件详解 文件名称：DeGiorgioDegnanRobustness.zip 文件格式：ZIP...
-
沈等人_补充材料_盲肠科_Plethodontidae_演化时间研究数据
2026年1月21日 30 102 96
数据集概述 本数据集为Plethodontidae蝾螈科演化时间研究的补充材料，包含基于50个独立核标记（共48,582 bp）的系统发育重建与分化时间分析相关数据，用于解决该科早期快速分化导致的系统发育关系争议，修正其起源时间假说。 文件详解 文件名称：Shen_et_al_Supplementary_Materials.zip 文件格式：ZIP...
