数据集概述
本数据集通过基因分型测序技术，分析海洋腹足类Crepidula属中两种不同扩散模式物种（C. convexa和C. fornicata）的核心与边缘种群遗传变异。包含遗传分化、多样性指标及采样坐标等数据，共12个文件，用于验证边缘种群遗传多样性降低的理论预测。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README_for_mergedSNPs.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含合并SNPs数据的相关信息
- 文件名称：Sampling coordinates and site codes.rtf
- 文件格式：RTF
- 字段映射介绍：采样点坐标及站位编码信息
- 数据输入类文件
- 文件名称：input_hierfstat_convexa.csv、input_hierfstat_fornicata.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：用于hierfstat分析的输入数据，包含种群遗传结构分析所需的基因型数据
- 文件名称：bayescan_input_convexa.txt、bayescan_input_fornicata.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：Bayescan分析的输入数据，用于检测选择信号
- 分析输出类文件
- 文件名称：bayescan_output_convexa.txt、bayescan_output_fornicata.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：Bayescan分析输出结果，包含选择信号检测的统计信息
- 文件名称：pairwise_distance_matrices.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：基于Fst的遗传距离矩阵及地理距离矩阵（单位：公里）
- 基因型数据文件
- 文件名称：filtered_SNPs_convexa.csv、filtered_SNPs_fornicata.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：过滤后的单核苷酸多态性（SNPs）数据
- 文件名称：mergedSNPs.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：合并后的SNPs数据文件，包含两种物种的基因型信息
数据来源
论文“Genetic differentiation but no reduction in genetic diversity at the northern range edge of two species with different dispersal modes”
适用场景
- 海洋生物遗传多样性研究: 分析不同扩散模式物种的核心与边缘种群遗传多样性差异
- 种群遗传结构分析: 利用hierfstat输入数据研究物种的种群分化程度
- 选择信号检测: 通过Bayescan输入输出文件检测自然选择对种群遗传的影响
- 地理距离与遗传距离相关性分析: 结合成对距离矩阵研究物种遗传分化的地理格局
- 边缘种群适应性研究: 探索边缘种群遗传多样性变化的功能后果及进化意义
