数据集概述
本数据集为气胞Cryo-EM结构研究的补充数据，包含2D类平均图像、AlphaFold2预测模型、GvpC蛋白对接结果及气体孔道分析文件，用于支持气胞伪原子模型构建、生物发生机制推导及进化保守性验证。
文件详解
- 2Dclasses_AnaMega_SeamsEdgesWallTips.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：含浮丝藻与巨大芽孢杆菌气胞的2D类平均图像，涵盖接缝、壁边缘、塌陷壁、尖端等特征，文件名含箱尺寸与像素尺寸，含用于 manuscript 展示的.png格式精选锐化2D类图像
- AlphaFold2_Models_5merRib_DifferentOrganisms.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：含5个不同进化关系生物（巨大芽孢杆菌GvpA1/A2、浮丝藻GvpA、盐沼盐杆菌GvpA1/A2）的气胞壁单肋AlphaFold2预测模型
- AnaGvpA_GvpC_ComputationalDocking_HADDOCK.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：含浮丝藻气胞中次要蛋白GvpC与GvpA的HADDOCK计算对接结果cif文件，含两种相反取向的可能结合模式
- GasPoreAnalysis.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：含用MOLE2.5分析相邻GvpA单体α螺旋1间气体孔道的3个隧道pdb文件（每行含埃为单位的收缩数据），及用于可视化的Chimera 1.13.1会话文件
数据来源
论文“Huber, S. T., et al. (2023). Cryo-EM structure of gas vesicles for buoyancy-controlled motility. Cell, 186(5), 975-986”
适用场景
- 生物大分子结构研究：分析气胞壁蛋白的α螺旋结构、侧链密度及进化保守性
- 蛋白质相互作用分析：验证GvpC与GvpA蛋白的结合模式及结构关联性
- 微生物运动机制研究：探究气胞结构与浮力控制运动功能的关系
- 进化生物学研究：通过不同生物气胞壁蛋白结构预测，分析气胞结构的进化保守性
- 生物信息学建模：利用AlphaFold2预测模型及HADDOCK对接结果，构建气胞伪原子模型
- 结构可视化分析：通过Chimera会话文件直观展示气体孔道结构特征
