数据集概述
本数据集围绕古热带地区苏铁科物种丰富度模式的成因展开,以苏铁科为模型系统,测试扩散频率、定殖时间、多样化速率及其组合对区域丰富度模式的影响。包含时间校准的系统发育树相关数据、生物地理重建结果、性状状态数据及序列比对文件,共7个文件,用于支撑古热带地区生物多样性驱动因素的研究。
文件详解
- 序列比对文件(.phy格式)
- 文件名称:cp3.phy、alignment.phy、nr7.phy
- 文件格式:PHY
- 字段映射介绍:包含苏铁科物种的核苷酸序列比对数据,用于构建系统发育树
- 生物地理重建结果文件(.csv格式)
- 文件名称:RASP-7.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含物种编号、物种名称及对应生物地理区域编码(如A、D、F等)
- 性状状态数据文件(.csv格式)
- 文件名称:MuHisse_states.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含物种名称及2个数值型性状状态变量
- 系统发育分析配置文件(.xml格式)
- 文件名称:BEAST2.xml
- 文件格式:XML
- 字段映射介绍:BEAST2软件的输入配置文件,用于时间校准的系统发育树构建
- 说明文件(.xlsx格式)
- 文件名称:ReadMe.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:数据集的说明文档,包含数据背景、文件说明等信息
数据来源
论文“Testing the causes of richness patterns in the paleotropics: time and diversification in cycads (Cycadaceae)”
适用场景
- 古热带地区生物多样性驱动因素研究: 分析定殖时间、多样化速率对苏铁科物种丰富度模式的影响
- 苏铁科系统发育与生物地理研究: 利用序列比对文件和生物地理重建结果,探究苏铁科物种的演化历史与地理分布格局
- 物种多样化速率分析: 通过性状状态数据和系统发育配置文件,研究苏铁科物种的多样化动态
- 生物地理边界效应研究: 验证华莱士线两侧苏铁科物种多样化速率的差异,分析生物地理边界对物种演化的影响