数据集概述
本数据集是关于大肠杆菌中关键GTP酶ObgE调控脂多糖(LPS)合成的科学研究伴随数据,包含蛋白质相互作用、结构预测、质谱分析等实验结果,支持解析ObgE与LpxA相互作用对LPS合成及细胞生长的调控机制。
文件详解
该数据集包含94个文件,覆盖多种实验数据类型,具体如下:
- 结构数据文件:
- .pdb格式文件(38个):如Citrobacter_koseri_Lpxa-ObgE_relaxed_rank_001.pdb,记录蛋白质复合物的三维结构模型
- .cif格式文件(2个):如Enterobacter Vc_LpxA-ObgE_relaxed_rank_001.cif,存储结构数据交换标准格式的结构信息
- 质谱分析文件:
- .xml格式文件(20个):如XLMS_Band4_LpxA_ObgE_wt_GTPgs_B12_search.xml,包含交联质谱(XLMS)搜索结果
- .xlsx格式文件(2个):SourceData.xlsx、SourceData_MS_MSMS.xlsx,汇总实验原始数据及质谱分析结果
- 可视化与预测数据文件:
- .png格式文件(24个):如Salmonella sp_LpxA-ObgE_coverage.png,展示序列覆盖度、结构预测可信度(pLDDT)等图像
- .json格式文件(8个):如Aeromonas_schubertii_LpxA-ObgE_predicted_aligned_error_v1.json,存储蛋白质结构预测的对齐误差数据
适用场景
- 微生物学研究:解析大肠杆菌细胞包膜合成的调控机制
- 蛋白质相互作用分析:研究GTP酶ObgE与LpxA的结合模式及功能影响
- 结构生物学研究:基于蛋白质复合物结构模型探究分子调控机制
- 抗菌药物研发:以ObgE-LpxA相互作用为靶点开发新型抗菌策略
- 细胞生长调控研究:分析ObgE在协调核糖体组装、DNA复制与包膜合成中的作用