数据集概述
本数据集为大麻哈鱼（Oncorhynchus keta）遗传连锁图谱构建研究的配套数据，包含通过最大似然法解析同源基因座后的基因型数据，用于揭示基因组中残留的四体遗传区域分布特征，为大麻哈鱼基因组进化及重二倍化进程研究提供基础数据。
文件详解
- 文件名称：taqMan_genotypes.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含大麻哈鱼多个基因座的基因型数据，涉及Oke_APOB-60、Oke_ccd16-77、Oke_CO1A1-72等基因座的分型信息
- 文件名称：RAD_genotypes.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：RAD测序技术获得的基因型数据压缩文件，包含大麻哈鱼基因组范围内的分子标记分型信息
- 文件名称：Catalog.tags.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 字段映射介绍：分子标记标签目录压缩文件，包含用于连锁图谱构建的标记序列及注释信息
数据来源
论文“Linkage mapping with paralogs exposes regions of residual tetrasomic inheritance in chum salmon (Oncorhynchus keta)”
适用场景
- 遗传连锁图谱构建: 利用解析后的同源基因座数据，构建包含或不包含同源基因座的大麻哈鱼连锁图谱
- 基因组重二倍化研究: 分析同源基因座在基因组中的分布特征，揭示大麻哈鱼基因组重二倍化进程中的残留四体遗传区域
- 分子标记开发与应用: 基于RAD测序数据及标记目录，开发大麻哈鱼遗传分析用分子标记
- 基因组进化分析: 结合转座元件注释信息，研究转座元件在大麻哈鱼基因组进化及染色体分化中的作用
