蛋白质结构接触频率分析数据集ProteinStructureContactFrequencyAnalysis-cdeotte
数据来源:互联网公开数据
标签:蛋白质结构, 生物信息学, 接触频率, 结构生物学, 分子动力学, 蛋白质建模, 机器学习, 数据分析
数据概述:
该数据集包含蛋白质结构数据,记录了蛋白质残基之间的接触频率信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为对蛋白质结构的静态分析。
地理范围:数据无地理范围限定,适用于对各类蛋白质结构的研究。
数据维度:数据集由.csv和.pdb文件组成,其中.csv文件包含蛋白质残基的接触频率统计数据,具体字段包括Residue_name(残基名称),Residue_number(残基编号),Total(总接触次数),Apolar(非极性接触),Backbone(主链接触),Sidechain(侧链接触),Ratio(接触比例),In/Out(残基位置,如内部或外部)。.pdb文件包含蛋白质的结构坐标信息。
数据格式:数据以.csv和.pdb格式提供,.csv文件便于数据分析,.pdb文件支持可视化和进一步的结构分析。数据来源为蛋白质结构数据库或其他公开资源,已进行标准化处理。
该数据集适合用于蛋白质结构分析、接触图构建、残基相互作用分析以及蛋白质结构预测等研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于结构生物学、生物化学等领域的学术研究,如蛋白质折叠、蛋白质-蛋白质相互作用、蛋白质结构稳定性分析等。
行业应用:为药物设计、生物技术公司提供数据支持,特别是在靶标识别、药物分子设计以及蛋白质工程方面。
决策支持:支持蛋白质结构相关研究的决策制定,辅助研究人员进行蛋白质结构预测和分析。
教育和培训:作为生物信息学、结构生物学等课程的辅助材料,帮助学生和研究人员深入理解蛋白质结构与功能的关系。
此数据集特别适合用于探索蛋白质残基接触模式与蛋白质功能之间的关系,帮助用户实现对蛋白质结构与性质的深入理解,优化药物设计和蛋白质工程策略。